97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0510 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  100 
 
 
439 aa  897    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  68.41 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  55 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  56.09 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  57.04 
 
 
447 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  55.47 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  54.23 
 
 
431 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  52.31 
 
 
431 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  49.4 
 
 
424 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  48.92 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  49.16 
 
 
429 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  51.38 
 
 
424 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  49.06 
 
 
428 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  45.9 
 
 
452 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  42.21 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  41.62 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  43.18 
 
 
457 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  41.13 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  41.73 
 
 
437 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  39.53 
 
 
428 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.28 
 
 
428 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  35.7 
 
 
439 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  38.44 
 
 
442 aa  279  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  34.54 
 
 
454 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.65 
 
 
464 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.65 
 
 
464 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  33.97 
 
 
454 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  32.73 
 
 
462 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  34.78 
 
 
462 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  35.16 
 
 
439 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  35.25 
 
 
400 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  35.53 
 
 
416 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  35.53 
 
 
416 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  35.53 
 
 
416 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  33.88 
 
 
452 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  34.39 
 
 
451 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.25 
 
 
400 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  33.85 
 
 
443 aa  236  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  33.33 
 
 
422 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  32.45 
 
 
431 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  32.45 
 
 
431 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  33.83 
 
 
445 aa  226  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  32.12 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  32.12 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  32.4 
 
 
432 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  31.9 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  32.99 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  30.95 
 
 
423 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  30.94 
 
 
425 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  29.37 
 
 
503 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.22 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  26.56 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  25.64 
 
 
422 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  28.43 
 
 
454 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.22 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  26.2 
 
 
417 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.22 
 
 
458 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  28.93 
 
 
418 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.63 
 
 
459 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  25.28 
 
 
459 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.55 
 
 
425 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.81 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  26.23 
 
 
452 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  24.56 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.76 
 
 
425 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  24.82 
 
 
633 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  25.24 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  23.56 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  23.46 
 
 
638 aa  73.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  23.28 
 
 
711 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.68 
 
 
1200 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  29.9 
 
 
707 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.04 
 
 
510 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.45 
 
 
172 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  23.72 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  23.3 
 
 
570 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  23.74 
 
 
422 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  25.24 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  25.84 
 
 
308 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  24.31 
 
 
672 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  26.95 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  21.29 
 
 
651 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  22.47 
 
 
647 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.53 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.49 
 
 
677 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  27.18 
 
 
648 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.42 
 
 
1969 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.88 
 
 
2036 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.11 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  20.94 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  24.2 
 
 
1242 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.62 
 
 
685 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  25.91 
 
 
871 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  24.88 
 
 
635 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  28.16 
 
 
899 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.32 
 
 
2272 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.1 
 
 
1332 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>