131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1626 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  100 
 
 
899 aa  1846    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  37.68 
 
 
863 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  35.53 
 
 
308 aa  156  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  32.23 
 
 
946 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  31.58 
 
 
707 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.56 
 
 
1969 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.18 
 
 
2036 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  31.53 
 
 
1200 aa  92.8  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  28.2 
 
 
648 aa  90.5  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.96 
 
 
2272 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  40.44 
 
 
172 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.33 
 
 
735 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
501 aa  82  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.79 
 
 
871 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  24.36 
 
 
1092 aa  77.8  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.33 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  30.98 
 
 
428 aa  73.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.69 
 
 
677 aa  73.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  44.44 
 
 
550 aa  72.8  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  31.22 
 
 
647 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.64 
 
 
375 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  31.55 
 
 
409 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  31.28 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.93 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.65 
 
 
458 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.23 
 
 
458 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  29.72 
 
 
671 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  27.98 
 
 
423 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  34.03 
 
 
972 aa  65.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  30.65 
 
 
570 aa  65.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  29.72 
 
 
352 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  27.91 
 
 
423 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  27.91 
 
 
423 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.53 
 
 
417 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  27.05 
 
 
431 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  26.94 
 
 
400 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  27.05 
 
 
431 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1927  hypothetical protein  26.09 
 
 
333 aa  62.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  31.71 
 
 
1001 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  31.21 
 
 
416 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.08 
 
 
547 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.16 
 
 
810 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  31.21 
 
 
400 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  26.29 
 
 
459 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30 
 
 
459 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  29.55 
 
 
360 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  30.64 
 
 
416 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  30.64 
 
 
416 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  30.64 
 
 
400 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  30.18 
 
 
505 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  27.69 
 
 
478 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  30.6 
 
 
638 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4051  hypothetical protein  28.69 
 
 
418 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749152  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.88 
 
 
510 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  44.16 
 
 
963 aa  56.2  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  25.69 
 
 
425 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  25.9 
 
 
548 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  31.54 
 
 
1332 aa  55.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.75 
 
 
483 aa  55.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.64 
 
 
471 aa  54.7  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  31.82 
 
 
669 aa  54.7  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  29.95 
 
 
564 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.53 
 
 
458 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  26.92 
 
 
1732 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  28.48 
 
 
446 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.72 
 
 
425 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  27.08 
 
 
419 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  23.81 
 
 
3295 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
1121 aa  52.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  32.17 
 
 
454 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.5 
 
 
1174 aa  53.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  28.74 
 
 
462 aa  52  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  29.3 
 
 
153 aa  51.6  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  28.35 
 
 
404 aa  51.6  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  29.52 
 
 
451 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.41 
 
 
467 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.6 
 
 
746 aa  51.2  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.26 
 
 
441 aa  51.2  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  26.29 
 
 
439 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  22.53 
 
 
384 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  29.8 
 
 
382 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 
863 aa  50.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.2 
 
 
1242 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.21 
 
 
410 aa  49.3  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.07 
 
 
573 aa  49.3  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  37.5 
 
 
992 aa  48.9  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  29.53 
 
 
513 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  27.65 
 
 
437 aa  48.9  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  24.68 
 
 
446 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.69 
 
 
1931 aa  48.5  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  26.12 
 
 
698 aa  48.5  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  24.07 
 
 
651 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  31.29 
 
 
454 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.5 
 
 
424 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  30.77 
 
 
1168 aa  48.5  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28.38 
 
 
804 aa  48.5  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.97 
 
 
467 aa  48.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2501  hypothetical protein  36.23 
 
 
843 aa  47.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.75 
 
 
595 aa  48.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>