24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0688 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
513 aa  1018    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28.49 
 
 
804 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  37.35 
 
 
972 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  42.79 
 
 
1628 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  32.92 
 
 
1242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  28.5 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.84 
 
 
1332 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  32.43 
 
 
1025 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  37.78 
 
 
1199 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  34.29 
 
 
564 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.38 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  43.37 
 
 
680 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.29 
 
 
899 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  32.32 
 
 
660 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 
749 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.86 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.46 
 
 
6885 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  28.85 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.61 
 
 
341 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0271  periplasmic copper-binding protein  60 
 
 
743 aa  44.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.819946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.95 
 
 
871 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  32.29 
 
 
918 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  32 
 
 
3802 aa  43.5  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.33 
 
 
467 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>