85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0648 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
972 aa  1917    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  55.71 
 
 
1242 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  43.7 
 
 
1628 aa  321  3.9999999999999996e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  35.98 
 
 
804 aa  226  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  49.58 
 
 
365 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  29.22 
 
 
1025 aa  145  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  37.35 
 
 
513 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  32.43 
 
 
1332 aa  127  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.62 
 
 
677 aa  97.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  32.26 
 
 
1200 aa  87.4  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  51.04 
 
 
1199 aa  87.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  36.17 
 
 
831 aa  80.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  37.61 
 
 
382 aa  73.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  31.39 
 
 
341 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.49 
 
 
899 aa  69.7  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.74 
 
 
594 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.93 
 
 
595 aa  69.7  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  39.71 
 
 
352 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  35.75 
 
 
892 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.61 
 
 
685 aa  66.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  31.56 
 
 
570 aa  65.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  32.24 
 
 
820 aa  65.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.99 
 
 
458 aa  64.3  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  40.19 
 
 
918 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.18 
 
 
871 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.09 
 
 
638 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  28.35 
 
 
720 aa  62.4  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.25 
 
 
647 aa  62.4  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  28.23 
 
 
1931 aa  62.4  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.78 
 
 
735 aa  61.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
1121 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.53 
 
 
641 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  33.58 
 
 
546 aa  57.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  36.07 
 
 
9585 aa  55.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  25 
 
 
1439 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.56 
 
 
510 aa  54.7  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  29.76 
 
 
471 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
805 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  42.27 
 
 
1160 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  37.74 
 
 
903 aa  52.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.95 
 
 
425 aa  52.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  30.22 
 
 
552 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.58 
 
 
1224 aa  51.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.03 
 
 
832 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 
497 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  27.27 
 
 
724 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  31.36 
 
 
375 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  26.71 
 
 
417 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  31.18 
 
 
500 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.22 
 
 
777 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  27.2 
 
 
2615 aa  49.3  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  29.84 
 
 
1056 aa  49.3  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  23.62 
 
 
954 aa  48.5  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  36.36 
 
 
308 aa  48.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  31.19 
 
 
1462 aa  48.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0271  periplasmic copper-binding protein  33.66 
 
 
743 aa  48.5  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.819946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  42.42 
 
 
1847 aa  48.1  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  26.34 
 
 
635 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.9 
 
 
940 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.18 
 
 
431 aa  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.18 
 
 
431 aa  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  38.03 
 
 
598 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.02 
 
 
934 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  37.84 
 
 
707 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  33.12 
 
 
1610 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  29.69 
 
 
1610 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  32.03 
 
 
409 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.24 
 
 
3911 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 
718 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.33 
 
 
6885 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  25.31 
 
 
833 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.87 
 
 
425 aa  45.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 
423 aa  45.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.84 
 
 
614 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  26.92 
 
 
838 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 
423 aa  45.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  35.25 
 
 
5453 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
674 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.46 
 
 
1448 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  22.75 
 
 
778 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  34.09 
 
 
651 aa  45.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  32.79 
 
 
224 aa  44.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  36.61 
 
 
505 aa  45.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  47.92 
 
 
302 aa  44.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  37.37 
 
 
803 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>