96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1510 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 505 aa  1038    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.45 
 
 		 1332 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  28.86 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  30.09 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  24.94 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.48 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  23.81 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  27.92 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.09 
 
 		 1628 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.13 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.48 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  25.79 
 
 		 831 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.43 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.33 
 
 		 677 aa  63.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.35 
 
 		 1242 aa  63.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.06 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  24.44 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.33 
 
 		 1969 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  22.92 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.73 
 
 		 2036 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  23.17 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  23.65 
 
 		 1200 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  21.97 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.08 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.08 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.15 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.15 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  21.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  31.61 
 
 		 707 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 		 899 aa  57.4  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  22.15 
 
 		 416 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  22.48 
 
 		 1931 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  22.94 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.22 
 
 		 685 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  22.57 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  27.93 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  24.71 
 
 		 641 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  24.57 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  23.17 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  22.37 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.62 
 
 		 2272 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  23.04 
 
 		 647 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  22.58 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  33.1 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.14 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  18.3 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  23.06 
 
 		 638 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  28.94 
 
 		 365 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  22.8 
 
 		 570 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.97 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  23.49 
 
 		 768 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  23.12 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  22.19 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  23.45 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.37 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  53.66 
 
 		 1300 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  21.96 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  24.69 
 
 		 804 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.22 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  24.76 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.58 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  37.36 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1682 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.64 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.64 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  21.18 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  23.9 
 
 		 805 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  21.87 
 
 		 451 aa  47  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  20.18 
 
 		 501 aa  47  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.9 
 
 		 820 aa  47  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  22.82 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  56.41 
 
 		 978 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.65 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  27.85 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  22.79 
 
 		 777 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  21.76 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.15 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  26.99 
 
 		 671 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  23.43 
 
 		 972 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.09 
 
 		 863 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  31.25 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  24.4 
 
 		 975 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  25.94 
 
 		 892 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  22.7 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  28.42 
 
 		 308 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  20.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  21.45 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  22.71 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  22.11 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  24.13 
 
 		 810 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  20.58 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>