39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6675 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 497 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.07 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  34.21 
 
 		 526 aa  123  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  32.71 
 
 		 539 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  32.33 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  29.7 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.95 
 
 		 536 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  33.65 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.71 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.34 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.34 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.96 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  28.1 
 
 		 867 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.52 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  27.17 
 
 		 874 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.93 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.5 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  32.61 
 
 		 998 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.61 
 
 		 998 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.3 
 
 		 1403 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.52 
 
 		 1839 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  26.35 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  24.52 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  33.63 
 
 		 1056 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.69 
 
 		 735 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  28.16 
 
 		 940 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31 
 
 		 1628 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.75 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  25.15 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 1610 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  27.33 
 
 		 1610 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.11 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.23 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.23 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  34.26 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.23 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28 
 
 		 553 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1439 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.35 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>