175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4777 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  69.8 
 
 
598 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  100 
 
 
803 aa  1645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  55.7 
 
 
483 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  55.01 
 
 
483 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  57.08 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  60.56 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  46.5 
 
 
492 aa  382  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  48.13 
 
 
471 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  47.43 
 
 
471 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  51.58 
 
 
727 aa  352  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  50 
 
 
565 aa  348  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  43.17 
 
 
729 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  43.17 
 
 
729 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  49.31 
 
 
699 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  33.05 
 
 
1113 aa  156  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.46 
 
 
6885 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.45 
 
 
1362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.33 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  28 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  28 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  27.71 
 
 
360 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  27.43 
 
 
360 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  27.14 
 
 
360 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  27.17 
 
 
360 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
360 aa  105  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  27.71 
 
 
420 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  27.43 
 
 
360 aa  103  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  27.43 
 
 
360 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  30.33 
 
 
464 aa  101  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  31.65 
 
 
455 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.72 
 
 
2170 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  34.07 
 
 
743 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  26.69 
 
 
846 aa  97.8  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.72 
 
 
1462 aa  97.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.36 
 
 
465 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.22 
 
 
455 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  27.27 
 
 
846 aa  95.5  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.84 
 
 
455 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.8 
 
 
455 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.84 
 
 
455 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  26.11 
 
 
543 aa  94.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.8 
 
 
455 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.12 
 
 
510 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25 
 
 
648 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  29.79 
 
 
458 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 
551 aa  93.2  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.65 
 
 
455 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.96 
 
 
458 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.9 
 
 
455 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.39 
 
 
455 aa  90.5  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.9 
 
 
455 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.99 
 
 
973 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
455 aa  89.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  36.08 
 
 
445 aa  87.8  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
459 aa  87.4  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 
1578 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  31.52 
 
 
1221 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  25 
 
 
848 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  25.65 
 
 
846 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.88 
 
 
795 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.23 
 
 
1628 aa  84.7  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  25.95 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  25.2 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.79 
 
 
762 aa  82.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  25.2 
 
 
680 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  36.88 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  36.88 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  36.88 
 
 
685 aa  81.3  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  26.79 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.87 
 
 
1887 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  23.33 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  26.97 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  24.71 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.83 
 
 
729 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  33.33 
 
 
2334 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.56 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  26.77 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25 
 
 
2286 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.87 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.08 
 
 
9585 aa  72  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  29.79 
 
 
561 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
809 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.99 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.26 
 
 
1160 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  35.36 
 
 
3802 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  32.97 
 
 
854 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.56 
 
 
2068 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.68 
 
 
1154 aa  65.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  29.06 
 
 
667 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 
1121 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  26.55 
 
 
467 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  30.48 
 
 
768 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.68 
 
 
1067 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 
1209 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  39.33 
 
 
1137 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.97 
 
 
703 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.46 
 
 
5743 aa  62.4  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  28.8 
 
 
189 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  31.91 
 
 
749 aa  61.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  37.21 
 
 
655 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>