63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0735 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
341 aa  700    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  64.77 
 
 
510 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  58.75 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  62.88 
 
 
648 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  59.35 
 
 
420 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  62.67 
 
 
468 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  61.04 
 
 
613 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  65.08 
 
 
460 aa  346  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  62.33 
 
 
467 aa  345  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  35.01 
 
 
376 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  33.61 
 
 
846 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  32.37 
 
 
680 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  33.53 
 
 
360 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  33.53 
 
 
360 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  33.53 
 
 
360 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  33.53 
 
 
360 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  32.52 
 
 
543 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.96 
 
 
846 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  31.94 
 
 
846 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  32.93 
 
 
360 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.54 
 
 
848 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  32.93 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  33.13 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  32.14 
 
 
360 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.23 
 
 
1362 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 
1578 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  39.06 
 
 
189 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.62 
 
 
782 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  30.25 
 
 
483 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  30.25 
 
 
483 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  29.6 
 
 
782 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 
471 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  27.52 
 
 
516 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
471 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
727 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  28.93 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.61 
 
 
551 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 
484 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.34 
 
 
492 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  27.54 
 
 
565 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.19 
 
 
729 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.19 
 
 
729 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.06 
 
 
598 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.78 
 
 
699 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.49 
 
 
803 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  34.01 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  32.16 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  53.49 
 
 
261 aa  56.2  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48142  chitinase 2 precursor  28.12 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333864  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  21.66 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  25.99 
 
 
1113 aa  51.2  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  26.36 
 
 
772 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.35 
 
 
623 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.35 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.91 
 
 
490 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  34.12 
 
 
1132 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  23.34 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  21.74 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  30.56 
 
 
521 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 
674 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  24.85 
 
 
407 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.37 
 
 
997 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>