70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4407 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  61.01 
 
 		 680 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  57.24 
 
 		 376 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  46 
 
 		 1362 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  40.52 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  40.52 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  40.52 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  40.52 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  40.79 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  40.52 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  40.13 
 
 		 360 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  39.87 
 
 		 174 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  40.13 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 551 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  40.14 
 
 		 510 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  41.13 
 
 		 848 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  41.18 
 
 		 846 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  40.43 
 
 		 846 aa  95.5  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  39.47 
 
 		 846 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  39.33 
 
 		 543 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  37.16 
 
 		 460 aa  89.4  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.16 
 
 		 648 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  34.01 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 		 1578 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  35.91 
 
 		 467 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  35.15 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  36.43 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  35.14 
 
 		 613 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  54.39 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  54.39 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  57.38 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  55.1 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  55.1 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  55.1 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  55.1 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  48.98 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  47.27 
 
 		 418 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  47.27 
 
 		 394 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 432 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  49.06 
 
 		 417 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  49.02 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  45.45 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  51.92 
 
 		 427 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  27.56 
 
 		 782 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  45.61 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  29.03 
 
 		 699 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  45.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  45.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  45.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  45.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  45.28 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  31.25 
 
 		 803 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  32.82 
 
 		 516 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  43.4 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  30.82 
 
 		 598 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  27.5 
 
 		 729 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  33.33 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  27.5 
 
 		 729 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  33.33 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.88 
 
 		 551 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 727 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  41.82 
 
 		 470 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  41.82 
 
 		 460 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  41.82 
 
 		 460 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  27.16 
 
 		 565 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  28.85 
 
 		 483 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  39.29 
 
 		 396 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  44.23 
 
 		 402 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  27.04 
 
 		 483 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>