201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0311 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  100 
 
 
445 aa  888    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  54.52 
 
 
396 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  52.28 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  52.28 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  50.91 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  50.91 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  50.91 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  50.91 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  48.18 
 
 
390 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  48.61 
 
 
402 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  51.07 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  51.57 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  46.42 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  46.42 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  46.42 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  46.42 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  46.42 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  49.1 
 
 
417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  43.99 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  47.3 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  46.88 
 
 
418 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  47.37 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  51.84 
 
 
389 aa  277  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  69.39 
 
 
165 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  47.89 
 
 
317 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  60.24 
 
 
225 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  31.04 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  28.95 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  28.88 
 
 
396 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  28.88 
 
 
396 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  29.17 
 
 
431 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  28.74 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  30.08 
 
 
444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  31.17 
 
 
451 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  31.17 
 
 
451 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  31.17 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  31.11 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
453 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
453 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
453 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  29.49 
 
 
453 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  29.72 
 
 
445 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  30.73 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  30.73 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  28.97 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  31.93 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  32.75 
 
 
432 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  29.64 
 
 
467 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  32.59 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  28.21 
 
 
463 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  28.78 
 
 
433 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  28.54 
 
 
418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  28.54 
 
 
418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  30.57 
 
 
534 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  28.65 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  28.65 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  28.5 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  28.39 
 
 
483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  28.39 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  28.5 
 
 
460 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
453 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
501 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  28.39 
 
 
483 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  28.39 
 
 
467 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
469 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  27.29 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  28.91 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
800 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
747 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
747 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
460 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  27.98 
 
 
467 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  28.24 
 
 
473 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>