196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0289 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  100 
 
 
445 aa  907    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  87.64 
 
 
444 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  71.43 
 
 
418 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  71.43 
 
 
418 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  64.78 
 
 
433 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  58.28 
 
 
534 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  52.1 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  52.1 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  52.1 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  51.88 
 
 
451 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4740  putative transposase  52.23 
 
 
358 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0251  putative transposase  69.95 
 
 
228 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2676  putative transposase  69.95 
 
 
228 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.376516  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  38.78 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  39.25 
 
 
431 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  38.85 
 
 
469 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  39.58 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  40.19 
 
 
445 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  40.43 
 
 
439 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  39.01 
 
 
439 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  39.36 
 
 
550 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  39.36 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  39.36 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  38.33 
 
 
460 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  39.36 
 
 
460 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
501 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  39.1 
 
 
453 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  39.42 
 
 
462 aa  243  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  243  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
467 aa  243  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  39.1 
 
 
467 aa  242  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  38.85 
 
 
800 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
483 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
469 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
460 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
747 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  39.12 
 
 
747 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  38.63 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
473 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  39.05 
 
 
467 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  38.63 
 
 
460 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  38.59 
 
 
460 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  38.59 
 
 
460 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  38.85 
 
 
460 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  38.85 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  39.53 
 
 
412 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  38.88 
 
 
460 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  38.7 
 
 
463 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  37.79 
 
 
483 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  37.79 
 
 
483 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  37.86 
 
 
544 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  38.6 
 
 
460 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  37.62 
 
 
432 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  38.86 
 
 
460 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  38.86 
 
 
460 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  38.79 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  38.79 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  39.16 
 
 
403 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  38.01 
 
 
426 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  39.06 
 
 
403 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  35.24 
 
 
478 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  38.27 
 
 
405 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  38.27 
 
 
405 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  39.15 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  38.27 
 
 
382 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  39.95 
 
 
427 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  40.25 
 
 
338 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  40.38 
 
 
347 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  40.2 
 
 
328 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  40.2 
 
 
328 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  38.74 
 
 
351 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  32.61 
 
 
428 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  32.61 
 
 
428 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  32.61 
 
 
428 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  32.61 
 
 
428 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  32.61 
 
 
428 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>