More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3970 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  100 
 
 
534 aa  1067    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  58.28 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  57.65 
 
 
444 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  56.7 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  56.7 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  53.51 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  53.54 
 
 
458 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  53.54 
 
 
451 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  53.3 
 
 
451 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  53.54 
 
 
451 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4740  putative transposase  52.79 
 
 
358 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  41.09 
 
 
430 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  38.26 
 
 
460 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
460 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
460 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
460 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
460 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  38.91 
 
 
460 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
460 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
550 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
460 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
460 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  38.83 
 
 
460 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  38.7 
 
 
483 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  38.38 
 
 
800 aa  246  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  38.7 
 
 
460 aa  246  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  38.39 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
460 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  38.18 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  38.7 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  38.7 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  38.7 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  36.94 
 
 
501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  38.18 
 
 
460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  38.01 
 
 
462 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  38.61 
 
 
473 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  39.85 
 
 
431 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  38.93 
 
 
483 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
747 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
747 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  38.48 
 
 
544 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  39.57 
 
 
460 aa  243  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  38.93 
 
 
483 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  39.26 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  39.35 
 
 
460 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  40.84 
 
 
412 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  38.91 
 
 
460 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  38.31 
 
 
469 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  40.75 
 
 
453 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  40.75 
 
 
453 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  39.71 
 
 
432 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  40.1 
 
 
445 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
443 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  40.72 
 
 
443 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  40.25 
 
 
403 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  37.72 
 
 
439 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  38.24 
 
 
478 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  40.38 
 
 
426 aa  228  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  37.66 
 
 
463 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  39.5 
 
 
403 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  39.51 
 
 
405 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  39.51 
 
 
405 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  40.32 
 
 
375 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  39.73 
 
 
382 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0251  putative transposase  55.07 
 
 
228 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2676  putative transposase  55.07 
 
 
228 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.376516  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  40.9 
 
 
338 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  37.12 
 
 
427 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  40.73 
 
 
347 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  34.72 
 
 
412 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  34.72 
 
 
412 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  34.72 
 
 
412 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  38.32 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  40.62 
 
 
328 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  33.75 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  33.75 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  33.75 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>