212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1135 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
443 aa  909    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  99.77 
 
 
445 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
443 aa  909    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
453 aa  932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
453 aa  932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
453 aa  932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  100 
 
 
453 aa  932    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  74.31 
 
 
439 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  68.13 
 
 
430 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  67.67 
 
 
431 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  63.35 
 
 
463 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  62.19 
 
 
453 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  61.97 
 
 
453 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  61.99 
 
 
469 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  59.26 
 
 
478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  58.64 
 
 
439 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  55.17 
 
 
469 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  55.4 
 
 
460 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
800 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
467 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
747 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
467 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
747 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
467 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  54.94 
 
 
460 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
544 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
550 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
483 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  54.84 
 
 
460 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  54.38 
 
 
460 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  54.71 
 
 
460 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  54.38 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  53.78 
 
 
462 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  57.68 
 
 
483 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
432 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  54.48 
 
 
460 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  54.25 
 
 
460 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  57.68 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  55.66 
 
 
412 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  55.53 
 
 
403 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  55.53 
 
 
403 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  58.81 
 
 
426 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  55.27 
 
 
427 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  55.76 
 
 
382 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  56.42 
 
 
405 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  56.42 
 
 
405 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  54.88 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  56.43 
 
 
338 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  55.95 
 
 
347 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  55.59 
 
 
328 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  55.59 
 
 
328 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02542  ISXo8 transposase  55 
 
 
495 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  59.73 
 
 
351 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  54.41 
 
 
470 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  60.58 
 
 
319 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02315  ISXo8 transposase  56.71 
 
 
337 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  44 
 
 
451 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  44 
 
 
458 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  44 
 
 
451 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  44 
 
 
451 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  55.8 
 
 
327 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  55.8 
 
 
313 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  55.8 
 
 
313 aa  285  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04444  ISXo8 transposase  59 
 
 
293 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00369  ISXo8 transposase  59 
 
 
286 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06262  ISXo8 transposase  58.58 
 
 
269 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01108  ISXo8 transposase  58.58 
 
 
269 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06248  ISXo8 transposase  58.58 
 
 
287 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0177744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03793  ISXo8 transposase  58.58 
 
 
286 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01070  ISXo8 transposase  58.58 
 
 
287 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>