191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1728 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  100 
 
 		 432 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  99.31 
 
 		 435 aa  817    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  76.63 
 
 		 418 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  73.91 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  76.68 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  57.11 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  57.11 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  57.11 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  41.75 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  40.92 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  40.29 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  38.7 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  38.35 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  38.71 
 
 		 483 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  38.46 
 
 		 460 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  38.46 
 
 		 460 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  37.62 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  37.62 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  38.61 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  38.61 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  38.46 
 
 		 501 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  37.97 
 
 		 800 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  38.02 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  38.12 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  38.12 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  38.12 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  37.97 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  37.78 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  37.29 
 
 		 550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  38.37 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  38.02 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  37.72 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  37.72 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  38.12 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  37.97 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  39.19 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  38.02 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  38.12 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 747 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  38.21 
 
 		 747 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  38.93 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  37.87 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  38.29 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  38.24 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  37.97 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  37.75 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  38.93 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  39.63 
 
 		 412 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  38.68 
 
 		 460 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  38.68 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  38.52 
 
 		 439 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  39.26 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  39.26 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  38.9 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  38.9 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  37.91 
 
 		 426 aa  222  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  40.32 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  40.58 
 
 		 375 aa  213  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  40.58 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  35.07 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  40.51 
 
 		 338 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  37.72 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  37.32 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  37.88 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  37.88 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  50 
 
 		 298 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  38.19 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  40.33 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  36.5 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>