188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4227 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  100 
 
 		 432 aa  868    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  88.28 
 
 		 418 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  73.91 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  97.78 
 
 		 390 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  73.38 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  57.6 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  57.6 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  57.6 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  37.02 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  36.36 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  36.36 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  36.36 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  36.36 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  38.26 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  38.26 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  36.78 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  36.21 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  34.38 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  35.43 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  50.47 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 483 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  33.49 
 
 		 460 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 483 aa  202  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 483 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  33.65 
 
 		 460 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 460 aa  202  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  33.74 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  33.65 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  33.33 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  35.05 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  32.77 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 473 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  34.24 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 469 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  32.77 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  33.41 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  33.17 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  33.17 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  33.17 
 
 		 800 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  33.67 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  33.25 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  34.19 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  34.61 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  32.93 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  34.29 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  33.75 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  33.75 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  33.5 
 
 		 460 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  33.94 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  34.29 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  32.86 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  36.15 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  33.94 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  33.94 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  35.74 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  35.74 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  36.06 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  36.06 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  36.06 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  35.53 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  36.29 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  35.53 
 
 		 338 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  35.95 
 
 		 328 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  35.62 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>