188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4487 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  100 
 
 
403 aa  843    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  46.58 
 
 
462 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  46.58 
 
 
462 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  46.58 
 
 
462 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  46.58 
 
 
462 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  45.53 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  45.19 
 
 
399 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  45.19 
 
 
399 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  45.26 
 
 
432 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  43 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  45.69 
 
 
427 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  42.93 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  39.31 
 
 
418 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  39.05 
 
 
394 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  37.72 
 
 
402 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  37.8 
 
 
401 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  38.01 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  38.01 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  44.85 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  38.01 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  38.01 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  38.01 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  36.73 
 
 
417 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  30.61 
 
 
396 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  30.61 
 
 
396 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  39.35 
 
 
317 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  55.56 
 
 
165 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  44.95 
 
 
225 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  29.68 
 
 
428 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  32.53 
 
 
443 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  32.53 
 
 
445 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  32.53 
 
 
443 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  32.28 
 
 
453 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  32.28 
 
 
453 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  32.28 
 
 
453 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  32.28 
 
 
453 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  29.56 
 
 
444 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  30.33 
 
 
451 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  26.76 
 
 
430 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  29.56 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  29.56 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  29.56 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  28.11 
 
 
467 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  28.26 
 
 
439 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  29.09 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  29.09 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  25.89 
 
 
431 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  29.2 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  28.33 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  31.73 
 
 
534 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  28.78 
 
 
460 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  26.47 
 
 
478 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  28.57 
 
 
427 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  26.93 
 
 
469 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  27.3 
 
 
433 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  28.57 
 
 
432 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  37.76 
 
 
319 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  28.5 
 
 
460 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  28.5 
 
 
460 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
473 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  28.29 
 
 
469 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
800 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  28.57 
 
 
460 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
467 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
467 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
460 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  28.75 
 
 
460 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  27.9 
 
 
483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
747 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  27.25 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  28.57 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  28.19 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  28.47 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  27.25 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
747 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  28.82 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  28.54 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>