80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1220 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  100 
 
 		 510 aa  1026    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  67.22 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  65.1 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  64.77 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  64.58 
 
 		 613 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  65.22 
 
 		 468 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  64.21 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  67.06 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  57.09 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  35.36 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  37.46 
 
 		 543 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  36.01 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  36.01 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  36.01 
 
 		 360 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  35.42 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.39 
 
 		 846 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  35.23 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  35.52 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 		 360 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  35.54 
 
 		 360 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  35.52 
 
 		 360 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  34.36 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  35.35 
 
 		 848 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  32.46 
 
 		 680 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  46.37 
 
 		 261 aa  186  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  34.97 
 
 		 846 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.02 
 
 		 1362 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.64 
 
 		 846 aa  178  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.21 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  55.62 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  55.81 
 
 		 551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  55.73 
 
 		 591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  55.73 
 
 		 763 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 1578 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  43.38 
 
 		 189 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 727 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  31.02 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  29.64 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  30.55 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  30.55 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  29.09 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  28.17 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  29.58 
 
 		 699 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  30.03 
 
 		 353 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.52 
 
 		 782 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  28.61 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  40.14 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  29.13 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.8 
 
 		 782 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.17 
 
 		 803 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  42.28 
 
 		 597 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  34.5 
 
 		 174 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  34.78 
 
 		 2031 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1024 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  26.58 
 
 		 334 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  24.59 
 
 		 1113 aa  53.9  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  24.08 
 
 		 674 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  24.08 
 
 		 674 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  24.08 
 
 		 674 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  24.08 
 
 		 674 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  24.08 
 
 		 674 aa  53.5  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  24.08 
 
 		 674 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0881  carbohydrate-binding, CenC-like protein  34.88 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000527436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  23.41 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08241  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92223]  26.32 
 
 		 961 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.879175  normal  0.0215178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  23.75 
 
 		 674 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48142  chitinase 2 precursor  24.68 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  23.29 
 
 		 674 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  29.03 
 
 		 827 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68871  chitinase 3 precursor  27.88 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688997  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  25.75 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.79 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  22.97 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  35.92 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  26.52 
 
 		 536 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>