46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3182 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  24.2 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  30.95 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  30.95 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  30.95 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  30.95 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  32.8 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  25.37 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  30.16 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  31.15 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  30.16 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.87 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  27.36 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  37.08 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  34.07 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  23.5 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 727 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  25.49 
 
 		 468 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  26.84 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  24.32 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  24.62 
 
 		 565 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.13 
 
 		 510 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  36.62 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  26.23 
 
 		 699 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  24.2 
 
 		 648 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  24.18 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.38 
 
 		 803 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  20.56 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.91 
 
 		 598 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  27.44 
 
 		 536 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  27.66 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  24.1 
 
 		 613 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.39 
 
 		 1362 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  25.87 
 
 		 680 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 1578 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  24.1 
 
 		 846 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  25.19 
 
 		 729 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  25.19 
 
 		 729 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.36 
 
 		 846 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  25.18 
 
 		 846 aa  46.2  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  25.18 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  28.41 
 
 		 467 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>