More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1917 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  100 
 
 		 613 aa  1233    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  59.18 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  75 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  66.23 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  74.25 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  61.4 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  61.04 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  64.54 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  56.27 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  35.71 
 
 		 680 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  35.8 
 
 		 360 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  35.8 
 
 		 360 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  35.8 
 
 		 360 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  34.77 
 
 		 543 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  36.42 
 
 		 376 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  35.5 
 
 		 360 aa  194  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  33.43 
 
 		 846 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  55.56 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  35.01 
 
 		 360 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  35.24 
 
 		 360 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  35.01 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  35.01 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  34.42 
 
 		 360 aa  180  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  32.71 
 
 		 846 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  32.57 
 
 		 846 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.72 
 
 		 1362 aa  173  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  30.28 
 
 		 848 aa  173  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  42.72 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.16 
 
 		 762 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  30.53 
 
 		 782 aa  127  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  40.08 
 
 		 997 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  57.6 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  29.38 
 
 		 782 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 1578 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  54.64 
 
 		 459 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  56.7 
 
 		 462 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  41.31 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  38.55 
 
 		 854 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 536 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  29.2 
 
 		 353 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  37.87 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  35.82 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  42.97 
 
 		 189 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.76 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.94 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  41.13 
 
 		 637 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.5 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  26.14 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  46.73 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 471 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  42.28 
 
 		 507 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.38 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  26.71 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 727 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.57 
 
 		 729 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.57 
 
 		 729 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  45.79 
 
 		 540 aa  98.2  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  26.46 
 
 		 483 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  24.43 
 
 		 803 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  48.94 
 
 		 542 aa  95.5  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  26.77 
 
 		 565 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  43.08 
 
 		 142 aa  94  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  25.9 
 
 		 699 aa  91.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.25 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  38.68 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.91 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42.34 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  35.07 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  36.84 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  36.14 
 
 		 1199 aa  84.7  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.24 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  36 
 
 		 2310 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.3 
 
 		 998 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  40.62 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  33.14 
 
 		 245 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 1128 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  40 
 
 		 619 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  37.22 
 
 		 1067 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  40.82 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  37.96 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.39 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  31.54 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  35.47 
 
 		 174 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.74 
 
 		 846 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  43.62 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  38.95 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.24 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  36.17 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  41.76 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  39.56 
 
 		 436 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  39.78 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  40.95 
 
 		 2305 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.82 
 
 		 674 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.82 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.3 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.48 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.8 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>