58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4053 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 376 aa  776    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  67.45 
 
 		 680 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  43.6 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  43.6 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  43.79 
 
 		 360 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  43.31 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  43.31 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  43.73 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  43.73 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  43.73 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  43.79 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  39.51 
 
 		 1362 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  37.61 
 
 		 543 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 		 1578 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  57.24 
 
 		 245 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.57 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  35.23 
 
 		 846 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  37.35 
 
 		 846 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 551 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.88 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  36.31 
 
 		 848 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  36.31 
 
 		 846 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  36.13 
 
 		 613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.08 
 
 		 648 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  33.23 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  32.46 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  32.86 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  42.37 
 
 		 174 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  31.87 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.71 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  43.26 
 
 		 189 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.65 
 
 		 551 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  25.34 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 471 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  26.33 
 
 		 492 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  26.29 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  25 
 
 		 729 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  25 
 
 		 729 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  25.78 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  25.65 
 
 		 483 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  24.37 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  24.36 
 
 		 699 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.2 
 
 		 803 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  24.47 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  23.99 
 
 		 782 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  24.66 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  25.7 
 
 		 1113 aa  57.4  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  32.67 
 
 		 827 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  27.66 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.67 
 
 		 536 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2164  glycoside hydrolase family 18  25.68 
 
 		 1233 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0772652  normal  0.613153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  27.27 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3907  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami nidase  29.17 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  32.52 
 
 		 997 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.5 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>