282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5990 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  100 
 
 		 648 aa  1275    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  60.33 
 
 		 613 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  67.22 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  41.67 
 
 		 680 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  62.34 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  75.79 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  62.88 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  63.25 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  60.69 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  62 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  32.23 
 
 		 846 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  34.04 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  31.81 
 
 		 846 aa  183  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  34.04 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  34.04 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  34.04 
 
 		 360 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  71.2 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.4 
 
 		 1362 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  31.12 
 
 		 848 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  61.7 
 
 		 516 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  34.34 
 
 		 360 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.88 
 
 		 846 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  31.87 
 
 		 376 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  33.63 
 
 		 360 aa  171  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  34.45 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  33.33 
 
 		 360 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  65.65 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  55.26 
 
 		 261 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  57.89 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  38.73 
 
 		 561 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 1578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  55.04 
 
 		 591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  55.04 
 
 		 763 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  41.79 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  30.51 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  39.8 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  39.51 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  40.8 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  39.51 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  41.58 
 
 		 455 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  39.6 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  39.6 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  42.57 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  38.89 
 
 		 455 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 		 743 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  38.61 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 762 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  42.39 
 
 		 2170 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  38.92 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  45.12 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  44.68 
 
 		 1160 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.05 
 
 		 729 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.05 
 
 		 729 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.95 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 471 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 		 809 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.45 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  49.59 
 
 		 597 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  29.08 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  40.38 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  36.18 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  41.11 
 
 		 1067 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  26.12 
 
 		 782 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  26.4 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.33 
 
 		 6885 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  35.83 
 
 		 458 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 727 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  26.83 
 
 		 565 aa  98.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  28.25 
 
 		 353 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.68 
 
 		 465 aa  98.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  26.44 
 
 		 699 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.13 
 
 		 782 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  27.56 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25 
 
 		 803 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  27.56 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 1004 aa  94.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  36.84 
 
 		 1221 aa  94.4  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 		 480 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  47.83 
 
 		 683 aa  90.9  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  38.28 
 
 		 189 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  32.44 
 
 		 3802 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  34.4 
 
 		 1628 aa  88.2  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  38.6 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.22 
 
 		 1887 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.31 
 
 		 795 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  35.67 
 
 		 174 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  35.59 
 
 		 768 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  37.7 
 
 		 2068 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  33.52 
 
 		 245 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  31.46 
 
 		 514 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  36.67 
 
 		 2286 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 		 1448 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  52.58 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  55.06 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  35.86 
 
 		 1050 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  37.37 
 
 		 692 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>