229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2713 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  87.4 
 
 
492 aa  847    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  87.4 
 
 
492 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 
492 aa  990    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  87.4 
 
 
492 aa  847    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  87.4 
 
 
492 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  87.6 
 
 
492 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  87.6 
 
 
492 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  87.4 
 
 
492 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  34.54 
 
 
683 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  34.54 
 
 
683 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  55.03 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  46.58 
 
 
485 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  48.25 
 
 
485 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  29.79 
 
 
529 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  30.6 
 
 
355 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  28.52 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  33.6 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  30.8 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  30.85 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  28.83 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  28.2 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  28.2 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  28.2 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.15 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  35.92 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.03 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  33.61 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  28.15 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  29.93 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  36.13 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  26.69 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  30.57 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  31.97 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  29.5 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  32.28 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  29.17 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  31.97 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  30.94 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.75 
 
 
1121 aa  74.7  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  30.66 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  27.57 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.86 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  27.37 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  33.59 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  30.41 
 
 
419 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  31.21 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.42 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.57 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  31.15 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  31.71 
 
 
544 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  33.15 
 
 
703 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.66 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.79 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  28.76 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
1137 aa  70.5  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  34.94 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.35 
 
 
344 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  31.97 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  31.97 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.14 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
1209 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.64 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  53.85 
 
 
680 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.64 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.52 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  32.07 
 
 
466 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  56.58 
 
 
648 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  29.52 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  33.1 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  26.04 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  31.08 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  27.56 
 
 
369 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  33.61 
 
 
368 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  27.56 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  28.87 
 
 
334 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  30.5 
 
 
458 aa  64.7  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.59 
 
 
455 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.46 
 
 
358 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.47 
 
 
458 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  26.04 
 
 
436 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.21 
 
 
358 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.56 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.34 
 
 
6885 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  48.61 
 
 
649 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.73 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.73 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.06 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  42.5 
 
 
465 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  30.41 
 
 
343 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  32.23 
 
 
455 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.61 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  25.42 
 
 
403 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  32.87 
 
 
282 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>