37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1459 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  100 
 
 
261 aa  500  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  47.86 
 
 
510 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  52.02 
 
 
680 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  55.56 
 
 
648 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  43.66 
 
 
516 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  55.04 
 
 
591 aa  131  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  55.04 
 
 
763 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  58.14 
 
 
526 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  53.79 
 
 
460 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  47.77 
 
 
490 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  56.49 
 
 
551 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  45.67 
 
 
597 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  66.67 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  54.72 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  53.06 
 
 
613 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.88 
 
 
1024 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  73.33 
 
 
467 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  34.23 
 
 
2031 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  42.86 
 
 
420 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  51.28 
 
 
543 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  36.3 
 
 
552 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  55.56 
 
 
848 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
876 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  55.56 
 
 
846 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  52.63 
 
 
846 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  43.75 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  50 
 
 
846 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  56.25 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  39.58 
 
 
360 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  41.67 
 
 
360 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  39.58 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  39.58 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  39.58 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  39.58 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  39.58 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
360 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4907  hypothetical protein  28.9 
 
 
825 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000428379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>