63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4225 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  70.08 
 
 		 516 aa  700    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  100 
 
 		 551 aa  1098    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.33 
 
 		 510 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  66.21 
 
 		 648 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  53.29 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  57.89 
 
 		 526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  32.13 
 
 		 360 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  49.15 
 
 		 261 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  52.21 
 
 		 490 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  32.13 
 
 		 360 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  31.83 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  31.83 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  56.92 
 
 		 591 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  56.92 
 
 		 763 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  56.92 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  31.42 
 
 		 360 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.52 
 
 		 1362 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 360 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  30.93 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  30.63 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  30.33 
 
 		 360 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.53 
 
 		 846 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  29.65 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.87 
 
 		 846 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  32.19 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  29.24 
 
 		 848 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 1578 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  33.46 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  28.27 
 
 		 846 aa  100  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  27.71 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  45.9 
 
 		 597 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  27.99 
 
 		 729 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  27.63 
 
 		 341 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  27.99 
 
 		 729 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  28.89 
 
 		 699 aa  94  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28.98 
 
 		 565 aa  91.3  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  29.76 
 
 		 483 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 727 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  27.64 
 
 		 613 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  29.17 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  28.8 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  25.63 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  28.89 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  33.73 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.28 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  26.42 
 
 		 1113 aa  67.8  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  27.56 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  29.22 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  35.04 
 
 		 2031 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  29.85 
 
 		 189 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  29.87 
 
 		 782 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  23.58 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  35.71 
 
 		 552 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  27.74 
 
 		 827 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  22.66 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  31.88 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1024 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.07 
 
 		 1051 aa  43.9  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.5 
 
 		 582 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>