199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0638 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  75.6 
 
 		 1053 aa  1595    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  58.95 
 
 		 855 aa  794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  77.49 
 
 		 1054 aa  1637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  56.01 
 
 		 1146 aa  971    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  54.02 
 
 		 772 aa  720    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  47.85 
 
 		 997 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  54.55 
 
 		 1127 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  57.51 
 
 		 904 aa  801    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  54.21 
 
 		 1127 aa  941    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  54.77 
 
 		 1127 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  54.73 
 
 		 1129 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  100 
 
 		 1051 aa  2155    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  53.99 
 
 		 1127 aa  936    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  48.83 
 
 		 760 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.4 
 
 		 484 aa  237  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.5 
 
 		 703 aa  221  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.3 
 
 		 372 aa  198  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  40.3 
 
 		 846 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  38.69 
 
 		 846 aa  172  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 652 aa  170  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.63 
 
 		 674 aa  170  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  30.21 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  40.48 
 
 		 846 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.63 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  39.29 
 
 		 848 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.63 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.63 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.63 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.63 
 
 		 674 aa  168  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.29 
 
 		 674 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  29.48 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  24.57 
 
 		 634 aa  164  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 674 aa  164  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.63 
 
 		 639 aa  164  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27.29 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.27 
 
 		 431 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  43.9 
 
 		 1152 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  41.97 
 
 		 1123 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  27.41 
 
 		 382 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  26.99 
 
 		 1271 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.18 
 
 		 848 aa  128  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.34 
 
 		 867 aa  127  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.23 
 
 		 396 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 868 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  28.79 
 
 		 377 aa  125  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  26.97 
 
 		 848 aa  125  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.53 
 
 		 868 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.66 
 
 		 868 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  26.49 
 
 		 855 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.34 
 
 		 868 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 868 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  26.91 
 
 		 505 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  26.82 
 
 		 401 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  26.87 
 
 		 563 aa  118  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.36 
 
 		 499 aa  117  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  27.33 
 
 		 869 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1080 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  24.84 
 
 		 398 aa  116  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 		 559 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  27.23 
 
 		 521 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  25.72 
 
 		 972 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  25.64 
 
 		 792 aa  112  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 1578 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.61 
 
 		 763 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  24.8 
 
 		 414 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  23.72 
 
 		 563 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 863 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.27 
 
 		 868 aa  105  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  38.61 
 
 		 1285 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1406 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  25.54 
 
 		 430 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.7 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  26.02 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  23.61 
 
 		 1362 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  29.83 
 
 		 373 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.87 
 
 		 388 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  29.22 
 
 		 425 aa  98.2  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.41 
 
 		 455 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 1246 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 465 aa  97.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 472 aa  95.5  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  23.51 
 
 		 854 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  22.58 
 
 		 657 aa  92  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.65 
 
 		 586 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  38.5 
 
 		 1219 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.1 
 
 		 675 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.08 
 
 		 407 aa  89  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.23 
 
 		 816 aa  87.4  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  29.36 
 
 		 662 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 355 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  68.63 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  72 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  24.32 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 1443 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.37 
 
 		 1047 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  23.53 
 
 		 762 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 375 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 1224 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.5 
 
 		 1059 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>