156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2572 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 355 aa  736    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  37.88 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  37.65 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  33.72 
 
 		 639 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  35.57 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  38.25 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.31 
 
 		 674 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.31 
 
 		 674 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 		 674 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.98 
 
 		 674 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  34.65 
 
 		 674 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.32 
 
 		 674 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  34.32 
 
 		 674 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  34.32 
 
 		 674 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  34.32 
 
 		 674 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  34.32 
 
 		 674 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  34.32 
 
 		 674 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  33.33 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  31.56 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  33.97 
 
 		 1271 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  32.96 
 
 		 652 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.59 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  31.78 
 
 		 559 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  34.87 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.34 
 
 		 388 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.25 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.49 
 
 		 499 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  30.06 
 
 		 439 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  32.12 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.26 
 
 		 869 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.8 
 
 		 868 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.14 
 
 		 867 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 652 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.49 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.48 
 
 		 868 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 868 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  28.36 
 
 		 563 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1080 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.03 
 
 		 868 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  29.21 
 
 		 407 aa  132  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 		 868 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  28.33 
 
 		 505 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.56 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  31.61 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  27.2 
 
 		 634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.49 
 
 		 868 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.34 
 
 		 703 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.34 
 
 		 762 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 863 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  29.86 
 
 		 763 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.84 
 
 		 431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  30.45 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 		 1246 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.96 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 1782 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.36 
 
 		 972 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.25 
 
 		 848 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  29.11 
 
 		 430 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.19 
 
 		 563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 1443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.14 
 
 		 854 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.24 
 
 		 848 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  29.02 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.25 
 
 		 855 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.61 
 
 		 1132 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 		 1598 aa  113  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.12 
 
 		 675 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.71 
 
 		 760 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.73 
 
 		 1127 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  26.98 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 1127 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  26.68 
 
 		 699 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 1776 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.47 
 
 		 1127 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 1127 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 1129 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  26.7 
 
 		 699 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  26.42 
 
 		 699 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  26.7 
 
 		 699 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  26.7 
 
 		 699 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.36 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  23.46 
 
 		 855 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 1578 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.44 
 
 		 861 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  25.83 
 
 		 1362 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  27.87 
 
 		 540 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  25.16 
 
 		 827 aa  92.8  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  26.09 
 
 		 772 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  22.27 
 
 		 997 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  24.93 
 
 		 1053 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 578 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  31.6 
 
 		 1115 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.01 
 
 		 662 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  23.7 
 
 		 1146 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 465 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>