117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0020 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  97.14 
 
 
699 aa  1364    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  97 
 
 
699 aa  1362    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  100 
 
 
699 aa  1439    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  98 
 
 
699 aa  1374    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  97.14 
 
 
699 aa  1363    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  49.16 
 
 
861 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  30.75 
 
 
1271 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.47 
 
 
972 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.75 
 
 
867 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 
868 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 
868 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.19 
 
 
869 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
863 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.8 
 
 
868 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.89 
 
 
848 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.86 
 
 
855 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.81 
 
 
868 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.82 
 
 
848 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.39 
 
 
868 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  27.32 
 
 
868 aa  144  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.83 
 
 
563 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 
674 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.25 
 
 
674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
674 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.8 
 
 
674 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.72 
 
 
674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.72 
 
 
674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.72 
 
 
674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.72 
 
 
674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.72 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.57 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.72 
 
 
674 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  30.91 
 
 
482 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.14 
 
 
377 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  26.15 
 
 
431 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  34.54 
 
 
373 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.02 
 
 
388 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  30.28 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.55 
 
 
1080 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 
484 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  28.08 
 
 
455 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.14 
 
 
382 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
355 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.14 
 
 
639 aa  103  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.1 
 
 
401 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  25.36 
 
 
451 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  24.62 
 
 
439 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.64 
 
 
703 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.2 
 
 
505 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  28.82 
 
 
854 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.98 
 
 
372 aa  98.2  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  28.27 
 
 
414 aa  97.8  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  26.13 
 
 
425 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
364 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.15 
 
 
1362 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 
426 aa  94.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.43 
 
 
366 aa  94.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  26.61 
 
 
762 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  28.52 
 
 
563 aa  92  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  24.55 
 
 
430 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.25 
 
 
763 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.57 
 
 
463 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  26.22 
 
 
827 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  26.13 
 
 
652 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.7 
 
 
396 aa  88.2  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
1782 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  23.33 
 
 
398 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25.37 
 
 
559 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  28.79 
 
 
792 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.27 
 
 
1132 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.17 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  29.37 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.67 
 
 
634 aa  81.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  28.17 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  26.48 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  26.73 
 
 
586 aa  79.7  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
370 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  27.78 
 
 
662 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  27.48 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.83 
 
 
542 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  24.29 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1246 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  25.28 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  24.03 
 
 
760 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
1443 aa  67.8  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 
1129 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  23.5 
 
 
1054 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  23.95 
 
 
1127 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  23.95 
 
 
1127 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 
1127 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 
1127 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
1598 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  21.31 
 
 
407 aa  64.3  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  24.88 
 
 
1051 aa  63.9  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  24.68 
 
 
675 aa  63.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 
1578 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>