172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6134 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  61.85 
 
 		 763 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 675 aa  1363    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 652 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  42.63 
 
 		 430 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  40.85 
 
 		 762 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  44.37 
 
 		 854 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  40.18 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  39.54 
 
 		 400 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  37.04 
 
 		 425 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  39.68 
 
 		 455 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  38.53 
 
 		 559 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  30.63 
 
 		 586 aa  248  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  35.32 
 
 		 451 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  36.88 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  37.47 
 
 		 521 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  31.65 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.47 
 
 		 674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.51 
 
 		 674 aa  198  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.74 
 
 		 674 aa  197  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.74 
 
 		 674 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.74 
 
 		 674 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 674 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 		 674 aa  195  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.51 
 
 		 674 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 652 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.89 
 
 		 639 aa  171  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  30.83 
 
 		 1271 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  32.24 
 
 		 539 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  28.34 
 
 		 482 aa  164  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 		 396 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  31.46 
 
 		 662 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  32.86 
 
 		 382 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.31 
 
 		 792 aa  156  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1080 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  30.99 
 
 		 542 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 540 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  31.48 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.65 
 
 		 651 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  31.69 
 
 		 536 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.93 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  32.22 
 
 		 372 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  33.44 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  29.77 
 
 		 869 aa  147  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  29.89 
 
 		 868 aa  147  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.48 
 
 		 868 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.8 
 
 		 867 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 868 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.6 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.6 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.92 
 
 		 401 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.12 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 863 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  31.52 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.35 
 
 		 848 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.18 
 
 		 868 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.15 
 
 		 499 aa  133  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  26.73 
 
 		 855 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  30.68 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  30.12 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  26.49 
 
 		 972 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.26 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  27.93 
 
 		 657 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 1578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.64 
 
 		 861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  29.16 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  27.37 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  28.72 
 
 		 772 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  28.38 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.43 
 
 		 463 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 364 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 355 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  27.07 
 
 		 760 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 		 1782 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  26.44 
 
 		 505 aa  113  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.74 
 
 		 1146 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  25.94 
 
 		 1362 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 1127 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.72 
 
 		 1127 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.48 
 
 		 1127 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 1127 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  32.08 
 
 		 855 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 1129 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.05 
 
 		 1054 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 904 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.4 
 
 		 1053 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  31.44 
 
 		 997 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 		 1246 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27 
 
 		 1051 aa  99  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  28.13 
 
 		 426 aa  95.1  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  37.42 
 
 		 393 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.92 
 
 		 407 aa  90.1  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  41.88 
 
 		 623 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 		 1598 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1443 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>