287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3485 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  66.34 
 
 
542 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  67.42 
 
 
536 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  68.87 
 
 
532 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  100 
 
 
539 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  89.26 
 
 
540 aa  926    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  77.84 
 
 
662 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  71.65 
 
 
540 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  74.46 
 
 
792 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  72.11 
 
 
651 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  52.39 
 
 
521 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  48.55 
 
 
703 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  34.72 
 
 
559 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  40.38 
 
 
430 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  38.95 
 
 
652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.46 
 
 
762 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  36.36 
 
 
400 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  35.6 
 
 
1271 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  36.29 
 
 
425 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  35.01 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.41 
 
 
854 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.11 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  34.41 
 
 
451 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  35.32 
 
 
455 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
586 aa  180  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.64 
 
 
674 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.18 
 
 
674 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.18 
 
 
674 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.18 
 
 
674 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.48 
 
 
674 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.6 
 
 
868 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.64 
 
 
674 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.02 
 
 
674 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  32.64 
 
 
674 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.02 
 
 
674 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 
674 aa  171  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
472 aa  170  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.93 
 
 
563 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  27.23 
 
 
869 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
868 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
868 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
674 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.85 
 
 
868 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.91 
 
 
868 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  32.13 
 
 
763 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.65 
 
 
855 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.1 
 
 
848 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.3 
 
 
868 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.08 
 
 
867 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  30.95 
 
 
675 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  32.91 
 
 
398 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
863 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.95 
 
 
848 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  30.57 
 
 
639 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  32.01 
 
 
482 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.08 
 
 
972 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  26.66 
 
 
1080 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  32.37 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.61 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
652 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.85 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
1578 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.28 
 
 
373 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.44 
 
 
505 aa  123  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.49 
 
 
1362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.37 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  36.57 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.21 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.47 
 
 
377 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  45.45 
 
 
552 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  28.53 
 
 
401 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  47.79 
 
 
467 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.17 
 
 
613 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.32 
 
 
499 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.83 
 
 
657 aa  107  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  31.17 
 
 
861 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
465 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
364 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.96 
 
 
407 aa  101  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.49 
 
 
366 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  42.71 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 
459 aa  91.3  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  40.95 
 
 
507 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  41.67 
 
 
514 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.32 
 
 
997 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.3 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  24.36 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.59 
 
 
1132 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  28.48 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  28.48 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  28.48 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  29.18 
 
 
699 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  29.37 
 
 
699 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.28 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
1127 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.04 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  24.63 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.14 
 
 
760 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>