More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6238 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  100 
 
 		 552 aa  1105    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  55.64 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  53.3 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  64.07 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  52.17 
 
 		 561 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  30.84 
 
 		 562 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  37.2 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  38.97 
 
 		 591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.93 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  34.11 
 
 		 597 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.32 
 
 		 613 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  33.79 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  29.34 
 
 		 751 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  46.21 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  41.59 
 
 		 652 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 449 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  32.01 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  55.32 
 
 		 462 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  31.21 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  48.44 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  53.19 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  29.68 
 
 		 504 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  30.38 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  38.77 
 
 		 997 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  32.51 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  30.5 
 
 		 451 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  31.45 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  29.68 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  31.21 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  32.16 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  31.21 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  29.48 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  29.27 
 
 		 623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  29.23 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  28.14 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  28.18 
 
 		 507 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  50.91 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  50.96 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 762 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  31.54 
 
 		 1194 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  27.87 
 
 		 2305 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  27.31 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  27.53 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  27.18 
 
 		 665 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  54.84 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  51.02 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  47.57 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  45.86 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.66 
 
 		 2310 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  26.97 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  45.28 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  27.14 
 
 		 324 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  26.43 
 
 		 324 aa  97.8  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  23.24 
 
 		 548 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  28.42 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  27.33 
 
 		 481 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  35.9 
 
 		 787 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  46 
 
 		 455 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  46 
 
 		 455 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.79 
 
 		 649 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  47 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  25.24 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  51.69 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  26.32 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  46 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  46 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50 
 
 		 809 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  25.63 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  25.27 
 
 		 897 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  25.63 
 
 		 686 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  25.27 
 
 		 897 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  25.63 
 
 		 686 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  45 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.95 
 
 		 854 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  56.79 
 
 		 973 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  48.21 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  35.29 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  35.34 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  43 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.29 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  48 
 
 		 743 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  43 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  43 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  32.53 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  43 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.61 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.28 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  48.31 
 
 		 1154 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  48.48 
 
 		 900 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  34.01 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.42 
 
 		 1007 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  47.66 
 
 		 658 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  55.29 
 
 		 1121 aa  78.2  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  39.78 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>