260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2285 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 462 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  86.8 
 
 		 459 aa  747    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  57.18 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  66.78 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  62.62 
 
 		 748 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  62.99 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  57.1 
 
 		 709 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  35.81 
 
 		 505 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  36.04 
 
 		 505 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 		 930 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  33.54 
 
 		 755 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  33.55 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  34.81 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  67.33 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  31.96 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  55.56 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32.58 
 
 		 610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  30.87 
 
 		 630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  30.79 
 
 		 1302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  32.01 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  30.63 
 
 		 638 aa  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1167 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  50 
 
 		 613 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  28.27 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  50.82 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.08 
 
 		 717 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  47.47 
 
 		 514 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  54.26 
 
 		 532 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  52.69 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 540 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  42.72 
 
 		 539 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  40.68 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  28.68 
 
 		 626 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  42.19 
 
 		 536 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  44 
 
 		 637 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.04 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  42.31 
 
 		 142 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  38.53 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  37.69 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  40 
 
 		 1007 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.61 
 
 		 1194 aa  77.4  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.85 
 
 		 2310 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.98 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  34.75 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  26.45 
 
 		 1221 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.34 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  40 
 
 		 906 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  37.25 
 
 		 925 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  22.9 
 
 		 651 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  35.16 
 
 		 997 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  38.89 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  36.17 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  38.89 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.36 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  41.05 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  36.47 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.36 
 
 		 880 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  23.1 
 
 		 1004 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.08 
 
 		 984 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  39.36 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 1209 aa  67.4  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  37.89 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  35.2 
 
 		 694 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  38.71 
 
 		 938 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  33.09 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  36.46 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  37.23 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.62 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.66 
 
 		 762 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  32.76 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 846 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  39.56 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  36.96 
 
 		 911 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  36.89 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 998 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  34 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  34 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.32 
 
 		 2305 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  25.35 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 1298 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  36.73 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.02 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  33.91 
 
 		 679 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  41.03 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  36.84 
 
 		 596 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  32.65 
 
 		 688 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  31.11 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  33.6 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 854 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.7 
 
 		 743 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  32.32 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  35.11 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.48 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  32.08 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  32 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  35.71 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  31.63 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.28 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>