120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0592 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  48.13 
 
 		 1146 aa  683    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  46.84 
 
 		 855 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  45.08 
 
 		 1127 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  100 
 
 		 760 aa  1580    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 1127 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  46.89 
 
 		 1053 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  51.21 
 
 		 904 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 1127 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  47.58 
 
 		 1129 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  45.34 
 
 		 1127 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  47.02 
 
 		 1054 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  48.83 
 
 		 1051 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  45.48 
 
 		 997 aa  592  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  42.99 
 
 		 772 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 484 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.54 
 
 		 372 aa  183  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 674 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.6 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.81 
 
 		 674 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.81 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.4 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.81 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.4 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.04 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  27.99 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.4 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.11 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  27.04 
 
 		 401 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  24.84 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.96 
 
 		 634 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  25.56 
 
 		 431 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  26.56 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.74 
 
 		 848 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 		 1246 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25.05 
 
 		 1271 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.16 
 
 		 703 aa  127  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 		 1443 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.4 
 
 		 499 aa  124  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.81 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  26.75 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  28.27 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  25.21 
 
 		 1132 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  29.69 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  22.77 
 
 		 377 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  27.92 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1782 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  23.98 
 
 		 848 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  24.16 
 
 		 855 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.96 
 
 		 398 aa  111  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  26.14 
 
 		 373 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 355 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  26.79 
 
 		 652 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.79 
 
 		 868 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.53 
 
 		 868 aa  108  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  27.33 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  26.12 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 868 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 868 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.13 
 
 		 868 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  24.38 
 
 		 396 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 867 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 863 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  26.71 
 
 		 869 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  24.95 
 
 		 854 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  26.81 
 
 		 425 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 426 aa  101  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.62 
 
 		 762 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1080 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  27.81 
 
 		 382 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  23.37 
 
 		 463 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.01 
 
 		 388 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.46 
 
 		 675 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 472 aa  98.2  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  23.89 
 
 		 563 aa  96.3  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  23.66 
 
 		 657 aa  96.3  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 1578 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.89 
 
 		 868 aa  94.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 		 1598 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  24.67 
 
 		 972 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  24.63 
 
 		 451 aa  90.9  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  25.63 
 
 		 651 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  26.76 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  26.49 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  24.75 
 
 		 407 aa  83.2  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10838  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 1233 aa  82  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  22.67 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  25.34 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  27.41 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  23.51 
 
 		 1362 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  27.85 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  24.78 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  22.42 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  25.41 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  26.15 
 
 		 539 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 1776 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  24.5 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>