More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1472 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  100 
 
 
540 aa  1097    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  73.59 
 
 
792 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  73.85 
 
 
539 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  68.89 
 
 
662 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  70.89 
 
 
542 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  70.89 
 
 
540 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  70.08 
 
 
536 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  65.05 
 
 
651 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  68.38 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  52.49 
 
 
521 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.73 
 
 
703 aa  339  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  38.36 
 
 
652 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  40.24 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.18 
 
 
559 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  34.6 
 
 
762 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  36.66 
 
 
400 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  37.34 
 
 
425 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  34.61 
 
 
1271 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  35.41 
 
 
854 aa  200  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.48 
 
 
674 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.03 
 
 
674 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  30.62 
 
 
867 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  33.03 
 
 
674 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.81 
 
 
674 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  33.41 
 
 
868 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.26 
 
 
674 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 
674 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  33.48 
 
 
674 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.81 
 
 
674 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.81 
 
 
674 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  33.99 
 
 
451 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.85 
 
 
439 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.81 
 
 
674 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.71 
 
 
869 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 
674 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  32.27 
 
 
414 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  33.58 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 
868 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  34.05 
 
 
868 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.82 
 
 
868 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  34.05 
 
 
868 aa  179  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  34.09 
 
 
763 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
868 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  35.6 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 
863 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.43 
 
 
848 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  32.06 
 
 
586 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.6 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 
472 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.62 
 
 
972 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.38 
 
 
855 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.04 
 
 
563 aa  161  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
652 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 
484 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.38 
 
 
848 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  28.6 
 
 
634 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  25.94 
 
 
639 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.93 
 
 
1080 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.4 
 
 
482 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  25.59 
 
 
657 aa  153  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  31.03 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  30.93 
 
 
675 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  30.83 
 
 
396 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.02 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  32.15 
 
 
431 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.72 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30 
 
 
373 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
1578 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.46 
 
 
388 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.48 
 
 
1362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  31.38 
 
 
377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.54 
 
 
499 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.56 
 
 
407 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  29.59 
 
 
366 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
465 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.82 
 
 
816 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30.28 
 
 
861 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 
355 aa  93.6  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  28.88 
 
 
401 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.49 
 
 
382 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  28.53 
 
 
997 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
364 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 
1443 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
1782 aa  90.1  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.22 
 
 
1132 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.41 
 
 
1057 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  40.65 
 
 
623 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.18 
 
 
1146 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  24.84 
 
 
772 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  35.91 
 
 
846 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
1246 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
1127 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  44.33 
 
 
1051 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  32.78 
 
 
846 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.69 
 
 
1127 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.69 
 
 
1127 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
1127 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  26.48 
 
 
699 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  27.07 
 
 
1053 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>