150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0218 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
586 aa  1165    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  42.93 
 
 
430 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  41.45 
 
 
652 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  40.34 
 
 
451 aa  270  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  41.75 
 
 
854 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  42.08 
 
 
559 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  39.27 
 
 
439 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.59 
 
 
762 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  40.81 
 
 
425 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  40.24 
 
 
703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.86 
 
 
675 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  37.35 
 
 
521 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  36.8 
 
 
400 aa  210  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  34.73 
 
 
455 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  37.19 
 
 
414 aa  193  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  30.6 
 
 
763 aa  186  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  35.31 
 
 
662 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  34.26 
 
 
651 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  33.89 
 
 
536 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  33.9 
 
 
539 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  35.66 
 
 
542 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.61 
 
 
482 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 
540 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  32.74 
 
 
540 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
472 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.85 
 
 
532 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
484 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  30.66 
 
 
639 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.57 
 
 
792 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
674 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  27.29 
 
 
674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.29 
 
 
674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  27.61 
 
 
674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  27.17 
 
 
674 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  26.68 
 
 
674 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  26.58 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  26.58 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  26.58 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  26.58 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.62 
 
 
868 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.05 
 
 
868 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
674 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.94 
 
 
1080 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.63 
 
 
867 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.5 
 
 
377 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.2 
 
 
869 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  32.44 
 
 
1271 aa  136  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.83 
 
 
373 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 
868 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.75 
 
 
868 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 
868 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 
863 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  27.59 
 
 
431 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  32.55 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  26.67 
 
 
372 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.09 
 
 
848 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.39 
 
 
388 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.34 
 
 
463 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.62 
 
 
398 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.47 
 
 
868 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
652 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  31.02 
 
 
972 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  25.25 
 
 
657 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30.54 
 
 
861 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.29 
 
 
505 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.1 
 
 
855 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.21 
 
 
396 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.41 
 
 
382 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.96 
 
 
1362 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  28.02 
 
 
401 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
355 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  28.61 
 
 
760 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
465 aa  107  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.98 
 
 
848 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.91 
 
 
407 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.47 
 
 
634 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 
1129 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
1127 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
1127 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  28.29 
 
 
1127 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  28.65 
 
 
1053 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  28.29 
 
 
1127 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  28.07 
 
 
1054 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 
1782 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.43 
 
 
563 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  28.65 
 
 
1051 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 
426 aa  94.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.78 
 
 
997 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
1246 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  28.03 
 
 
1146 aa  90.1  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  26.69 
 
 
855 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
1443 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
1578 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
904 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  24.55 
 
 
1132 aa  87  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  25.34 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.08 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.08 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.08 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  26.74 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>