231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2136 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  85.93 
 
 		 868 aa  1541    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  74.28 
 
 		 863 aa  1316    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  85.7 
 
 		 868 aa  1539    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  100 
 
 		 869 aa  1771    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  81.55 
 
 		 868 aa  1471    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  79.35 
 
 		 868 aa  1404    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  85.81 
 
 		 868 aa  1541    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  48.11 
 
 		 972 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  81.08 
 
 		 868 aa  1459    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.36 
 
 		 848 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  49.41 
 
 		 855 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  74.95 
 
 		 563 aa  864    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  86.84 
 
 		 867 aa  1558    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  51.01 
 
 		 848 aa  742    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  46.37 
 
 		 1271 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  34.44 
 
 		 431 aa  241  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  28.14 
 
 		 861 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 674 aa  214  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.42 
 
 		 674 aa  207  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.05 
 
 		 674 aa  207  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  207  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.8 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 674 aa  206  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.11 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.11 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.11 
 
 		 674 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  34.05 
 
 		 674 aa  205  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.11 
 
 		 674 aa  205  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  37.66 
 
 		 985 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 		 484 aa  198  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.19 
 
 		 703 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  31.67 
 
 		 652 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  34.37 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.71 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.13 
 
 		 792 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1080 aa  178  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.18 
 
 		 854 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 652 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  31.51 
 
 		 398 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.77 
 
 		 532 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  31.34 
 
 		 505 aa  173  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.36 
 
 		 639 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.52 
 
 		 762 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  30.99 
 
 		 430 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.79 
 
 		 482 aa  171  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  32.13 
 
 		 425 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  36.64 
 
 		 377 aa  166  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.6 
 
 		 651 aa  166  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  35.5 
 
 		 373 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  28.52 
 
 		 699 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  34.82 
 
 		 388 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  28.17 
 
 		 559 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  29.41 
 
 		 414 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  28.34 
 
 		 699 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  29.78 
 
 		 542 aa  157  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  28.16 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  27.47 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  28.19 
 
 		 699 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  30.19 
 
 		 662 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  33.87 
 
 		 401 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  29.47 
 
 		 539 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  28.28 
 
 		 439 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  28.85 
 
 		 536 aa  151  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  29.98 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.86 
 
 		 1362 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.97 
 
 		 400 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.56 
 
 		 451 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 355 aa  144  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  29.2 
 
 		 763 aa  144  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.78 
 
 		 463 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 364 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.32 
 
 		 675 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.11 
 
 		 407 aa  138  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 		 472 aa  137  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.12 
 
 		 372 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  30.2 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.31 
 
 		 366 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 1578 aa  128  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  26.88 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  32.21 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  31.23 
 
 		 1782 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.34 
 
 		 1146 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 1127 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.33 
 
 		 1051 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.55 
 
 		 1127 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.71 
 
 		 382 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  29.27 
 
 		 1132 aa  115  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  30.06 
 
 		 1127 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 1127 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 1129 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  30.09 
 
 		 772 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  29.31 
 
 		 997 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 904 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.4 
 
 		 634 aa  107  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  28.45 
 
 		 1054 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  22.66 
 
 		 657 aa  104  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 		 1246 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.71 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>