130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3476 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3476  chitinase  100 
 
 		 499 aa  1036    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  53.38 
 
 		 1271 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 		 674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.42 
 
 		 674 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.42 
 
 		 674 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.84 
 
 		 674 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  35.84 
 
 		 674 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 674 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  35.55 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  35.55 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  35.55 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  35.55 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  35.26 
 
 		 674 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  30.14 
 
 		 639 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  33.25 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  32.28 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  29.56 
 
 		 398 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.47 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.53 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.58 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  33.57 
 
 		 521 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 484 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 652 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  28.71 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.29 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.59 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.56 
 
 		 1053 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.03 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  26.32 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.37 
 
 		 1146 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26.83 
 
 		 634 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 1782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.83 
 
 		 868 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  31.83 
 
 		 868 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 1578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.83 
 
 		 848 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 652 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  28.13 
 
 		 425 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  25.45 
 
 		 1054 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  30.9 
 
 		 867 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.18 
 
 		 868 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.14 
 
 		 848 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 868 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  24.07 
 
 		 772 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 1129 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  25.4 
 
 		 760 aa  124  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  28.38 
 
 		 855 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.21 
 
 		 869 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1080 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.81 
 
 		 868 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 863 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.2 
 
 		 972 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  24.88 
 
 		 559 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.42 
 
 		 868 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.36 
 
 		 1051 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  24.49 
 
 		 1132 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  29.13 
 
 		 563 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 1127 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  24.38 
 
 		 1127 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  24.16 
 
 		 1127 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 1127 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  23.85 
 
 		 997 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.49 
 
 		 675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  30.28 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.41 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  26.63 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  27.09 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  23.61 
 
 		 855 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  27.54 
 
 		 540 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 1246 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  25.3 
 
 		 662 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 		 1598 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.38 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  25.71 
 
 		 563 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.73 
 
 		 657 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  24.27 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.33 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  26.27 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.36 
 
 		 1362 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  24.93 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  25.59 
 
 		 651 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 1443 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  26.6 
 
 		 532 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  26.78 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  24.72 
 
 		 703 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.89 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  26.11 
 
 		 854 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  23.86 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.02 
 
 		 400 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 		 370 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 1776 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.73 
 
 		 762 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>