129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3870 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 1271 aa  2586    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  51.28 
 
 		 499 aa  429  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  47.07 
 
 		 868 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 		 868 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  46.37 
 
 		 869 aa  389  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  46.84 
 
 		 868 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  46.37 
 
 		 867 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  45.09 
 
 		 848 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  46.37 
 
 		 868 aa  390  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  45.9 
 
 		 868 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  45.09 
 
 		 855 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  45.09 
 
 		 848 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  40.26 
 
 		 563 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 863 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  45.43 
 
 		 868 aa  370  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  43.33 
 
 		 972 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  41.82 
 
 		 431 aa  327  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  36.3 
 
 		 674 aa  268  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  36.3 
 
 		 674 aa  268  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  36.3 
 
 		 674 aa  268  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  36.88 
 
 		 674 aa  268  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  36.07 
 
 		 674 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  36.07 
 
 		 674 aa  266  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.34 
 
 		 674 aa  265  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  37.29 
 
 		 674 aa  265  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.34 
 
 		 674 aa  265  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.83 
 
 		 674 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 		 674 aa  261  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  35.36 
 
 		 482 aa  240  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.3 
 
 		 639 aa  232  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 		 484 aa  231  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  33.6 
 
 		 521 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.79 
 
 		 792 aa  227  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  36.58 
 
 		 651 aa  226  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.92 
 
 		 703 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  33.77 
 
 		 762 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  31.74 
 
 		 652 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  35.83 
 
 		 542 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  35.6 
 
 		 539 aa  217  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  36.24 
 
 		 532 aa  215  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  35.84 
 
 		 398 aa  212  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  32.32 
 
 		 540 aa  211  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  32.39 
 
 		 861 aa  208  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 540 aa  207  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  32.53 
 
 		 854 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  36.34 
 
 		 536 aa  201  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  37.92 
 
 		 377 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  34.89 
 
 		 662 aa  198  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 652 aa  196  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  32.61 
 
 		 505 aa  191  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  33.18 
 
 		 430 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1080 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  31.01 
 
 		 425 aa  187  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  31.49 
 
 		 463 aa  184  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  30.97 
 
 		 699 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  31.92 
 
 		 414 aa  182  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  30.92 
 
 		 699 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  30.97 
 
 		 699 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  37.66 
 
 		 388 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  36.19 
 
 		 373 aa  180  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  29.56 
 
 		 372 aa  179  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 1578 aa  179  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  31.11 
 
 		 400 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  30.75 
 
 		 699 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  30.75 
 
 		 699 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  35.89 
 
 		 382 aa  176  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  35.86 
 
 		 401 aa  175  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  29.06 
 
 		 559 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 364 aa  170  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 1782 aa  165  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 355 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  34.33 
 
 		 396 aa  162  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  30.06 
 
 		 675 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  27.46 
 
 		 451 aa  159  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 465 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  28.29 
 
 		 657 aa  152  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  27.4 
 
 		 634 aa  151  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.02 
 
 		 1362 aa  151  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  28.05 
 
 		 1146 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  27.8 
 
 		 439 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  29.02 
 
 		 763 aa  148  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  29.2 
 
 		 455 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 1127 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 1129 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.16 
 
 		 1127 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  24.84 
 
 		 1127 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.38 
 
 		 407 aa  139  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 1127 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  29.5 
 
 		 1132 aa  137  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  26.1 
 
 		 772 aa  136  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.9 
 
 		 1051 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 1246 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 472 aa  133  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 426 aa  132  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  31.85 
 
 		 586 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  25.21 
 
 		 760 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 1443 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  25.5 
 
 		 1054 aa  129  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  25.7 
 
 		 1053 aa  127  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 904 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>