276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0106 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000945  chitinase  76.56 
 
 		 848 aa  1338    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  50.94 
 
 		 868 aa  762    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  51.23 
 
 		 868 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  51.01 
 
 		 869 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  76.74 
 
 		 855 aa  1339    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  49.65 
 
 		 868 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  48.35 
 
 		 868 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  49.62 
 
 		 972 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  51.11 
 
 		 868 aa  763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  100 
 
 		 848 aa  1735    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  48.23 
 
 		 863 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  50.77 
 
 		 867 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  50.3 
 
 		 868 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  52.97 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  45.09 
 
 		 1271 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  33.33 
 
 		 431 aa  241  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  30.52 
 
 		 674 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  30.71 
 
 		 674 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.86 
 
 		 674 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  30.44 
 
 		 674 aa  226  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  30.68 
 
 		 674 aa  226  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  30.55 
 
 		 674 aa  225  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  30.55 
 
 		 674 aa  225  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 674 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.39 
 
 		 674 aa  219  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 674 aa  217  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.39 
 
 		 674 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  28.55 
 
 		 861 aa  205  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  31.55 
 
 		 652 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.96 
 
 		 703 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1080 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 484 aa  177  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.45 
 
 		 762 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  31.07 
 
 		 521 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  29.43 
 
 		 540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  28.9 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.91 
 
 		 505 aa  167  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  30.04 
 
 		 854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  31.11 
 
 		 430 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  30.89 
 
 		 532 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.94 
 
 		 792 aa  164  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 652 aa  164  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  33.65 
 
 		 377 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  26.79 
 
 		 699 aa  158  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.07 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.71 
 
 		 398 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.26 
 
 		 662 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  26.89 
 
 		 699 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  26.63 
 
 		 699 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.11 
 
 		 699 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  26.95 
 
 		 699 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  29.18 
 
 		 539 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  26.89 
 
 		 559 aa  152  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.67 
 
 		 1146 aa  150  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  29.28 
 
 		 414 aa  149  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  32.63 
 
 		 373 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.08 
 
 		 651 aa  147  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  33.63 
 
 		 388 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  28.89 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  29.21 
 
 		 542 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  26.61 
 
 		 451 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 540 aa  142  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  29.09 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 364 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.97 
 
 		 400 aa  138  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  25.71 
 
 		 439 aa  137  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.14 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 904 aa  134  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.42 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.6 
 
 		 1127 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.6 
 
 		 1127 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.74 
 
 		 760 aa  131  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 1127 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.82 
 
 		 997 aa  131  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.18 
 
 		 1051 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 1127 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.42 
 
 		 463 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.08 
 
 		 372 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.27 
 
 		 675 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.19 
 
 		 1362 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  29.83 
 
 		 499 aa  127  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.28 
 
 		 455 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.4 
 
 		 1057 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 1578 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 355 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 1129 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.71 
 
 		 382 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.97 
 
 		 1053 aa  120  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 472 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  37.55 
 
 		 816 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  25.83 
 
 		 772 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 465 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  25.45 
 
 		 1054 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  25.56 
 
 		 855 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  30.35 
 
 		 985 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.67 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.07 
 
 		 657 aa  109  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  26.3 
 
 		 396 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 1782 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.55 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>