More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0622 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1057 aa  2108    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  57.47 
 
 		 816 aa  365  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  60.89 
 
 		 623 aa  253  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  38.19 
 
 		 611 aa  228  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  33.59 
 
 		 842 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  36.19 
 
 		 734 aa  174  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.27 
 
 		 1565 aa  172  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.83 
 
 		 1094 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.63 
 
 		 1771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.04 
 
 		 1916 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1667 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  55.11 
 
 		 1150 aa  144  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  27.35 
 
 		 1528 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.99 
 
 		 2272 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.45 
 
 		 792 aa  132  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33.13 
 
 		 517 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  39.02 
 
 		 521 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  51.43 
 
 		 2066 aa  129  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  40 
 
 		 855 aa  128  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  40.16 
 
 		 634 aa  127  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1682 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  39.22 
 
 		 848 aa  124  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  25.97 
 
 		 2176 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 		 699 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  41.04 
 
 		 873 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  55.4 
 
 		 461 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  48.59 
 
 		 563 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.95 
 
 		 848 aa  115  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 		 1606 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  25.55 
 
 		 859 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.37 
 
 		 752 aa  112  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.83 
 
 		 1842 aa  111  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.11 
 
 		 1602 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.73 
 
 		 1862 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  24.52 
 
 		 561 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  26.97 
 
 		 679 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.23 
 
 		 930 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.35 
 
 		 2554 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  24.51 
 
 		 1814 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  38.96 
 
 		 1362 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.43 
 
 		 963 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  26.89 
 
 		 1011 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  41.78 
 
 		 1556 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  40.21 
 
 		 552 aa  105  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29 
 
 		 1236 aa  104  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.59 
 
 		 735 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  28.23 
 
 		 685 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  26.4 
 
 		 669 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.08 
 
 		 1027 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.87 
 
 		 1389 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.42 
 
 		 1620 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  29.4 
 
 		 2036 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  27.11 
 
 		 713 aa  102  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  27.88 
 
 		 675 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25.29 
 
 		 1011 aa  101  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  25.27 
 
 		 1361 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  39.77 
 
 		 917 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  23.94 
 
 		 1783 aa  100  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.29 
 
 		 1300 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  41.85 
 
 		 3197 aa  99.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  25.43 
 
 		 1387 aa  99  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  24.83 
 
 		 978 aa  98.6  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1282 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  29.52 
 
 		 971 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  43.04 
 
 		 3197 aa  96.3  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  26.6 
 
 		 658 aa  95.9  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  26.89 
 
 		 861 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  27.75 
 
 		 1356 aa  95.9  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.7 
 
 		 575 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2740  hypothetical protein  47.83 
 
 		 478 aa  94.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.77 
 
 		 1120 aa  94.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.92 
 
 		 1667 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.2 
 
 		 1882 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  42.42 
 
 		 766 aa  93.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.67 
 
 		 2122 aa  92  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.54 
 
 		 2000 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  39.22 
 
 		 944 aa  92  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  32.86 
 
 		 823 aa  91.3  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  28.84 
 
 		 460 aa  91.3  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.76 
 
 		 938 aa  90.9  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  30.2 
 
 		 528 aa  90.9  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  27.82 
 
 		 958 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 		 3295 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.95 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.91 
 
 		 1969 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.73 
 
 		 947 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  30.77 
 
 		 1292 aa  89.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 317 aa  89.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 		 942 aa  89.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.95 
 
 		 848 aa  88.2  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  36.73 
 
 		 1095 aa  88.2  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  35.62 
 
 		 523 aa  88.2  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.46 
 
 		 1732 aa  87.8  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  28.43 
 
 		 869 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 		 910 aa  87.4  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  38.55 
 
 		 713 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.43 
 
 		 615 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  35.22 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.38 
 
 		 1371 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.43 
 
 		 940 aa  87  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>