236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3805 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 917 aa  1810    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3832  parallel beta-helix repeat protein  30.23 
 
 		 870 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.84 
 
 		 816 aa  94.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.85 
 
 		 1057 aa  92.8  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 734 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  28.88 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  39.78 
 
 		 1565 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  39.38 
 
 		 1916 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.52 
 
 		 2272 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  27.57 
 
 		 675 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  33.92 
 
 		 623 aa  78.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.91 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  38.02 
 
 		 1150 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.81 
 
 		 669 aa  76.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.41 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.43 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.63 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  21.64 
 
 		 1094 aa  75.5  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.41 
 
 		 658 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.3 
 
 		 978 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1682 aa  71.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  27.31 
 
 		 517 aa  70.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.33 
 
 		 1300 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.96 
 
 		 1969 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  27.44 
 
 		 1011 aa  69.7  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.53 
 
 		 3197 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.78 
 
 		 2000 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  34.39 
 
 		 938 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25 
 
 		 2036 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  32.96 
 
 		 3295 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  26.89 
 
 		 581 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  24.76 
 
 		 1120 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  23.01 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1667 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.16 
 
 		 865 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  28.16 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.54 
 
 		 963 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.24 
 
 		 910 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  32.17 
 
 		 936 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  32.17 
 
 		 936 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  25.17 
 
 		 1882 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  25.87 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.64 
 
 		 752 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  44.71 
 
 		 2031 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.52 
 
 		 2176 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  35.25 
 
 		 935 aa  62.4  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  32.43 
 
 		 2066 aa  62.4  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  32.2 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.44 
 
 		 1667 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  34.17 
 
 		 861 aa  61.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.39 
 
 		 2122 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  26.25 
 
 		 551 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  35.25 
 
 		 456 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1390 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 918 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  28.02 
 
 		 873 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  27.93 
 
 		 864 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  33.12 
 
 		 938 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.05 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.5 
 
 		 1842 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.51 
 
 		 940 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  38.82 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  24.6 
 
 		 1862 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.48 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  35.29 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  25.48 
 
 		 1356 aa  58.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  24.58 
 
 		 1528 aa  58.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25 
 
 		 1241 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  26.34 
 
 		 1361 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0633  hypothetical protein  27.72 
 
 		 579 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00895594  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  30.58 
 
 		 955 aa  57.4  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  24.91 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  25.38 
 
 		 561 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1147  Fibronectin type III domain protein  28.49 
 
 		 979 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.478266  hitchhiker  0.000177205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.52 
 
 		 941 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  41.11 
 
 		 487 aa  57.4  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.11 
 
 		 3197 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  23.19 
 
 		 2554 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.3 
 
 		 1602 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  26.44 
 
 		 600 aa  55.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  24.23 
 
 		 861 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  22.79 
 
 		 929 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 		 1601 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  29.52 
 
 		 816 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.8 
 
 		 2117 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  32.35 
 
 		 960 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  26.44 
 
 		 615 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  28.42 
 
 		 938 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  32.35 
 
 		 960 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  41.38 
 
 		 554 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  27.44 
 
 		 1231 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.07 
 
 		 792 aa  55.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  36.81 
 
 		 841 aa  55.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  28.09 
 
 		 184 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  42.47 
 
 		 943 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  38.14 
 
 		 778 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  44.87 
 
 		 1444 aa  54.7  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.37 
 
 		 650 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  34.19 
 
 		 993 aa  54.3  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>