14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3832 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3832  parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 870 aa  1721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  29.93 
 
 		 917 aa  121  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  27.54 
 
 		 822 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  26.18 
 
 		 865 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2870  hypothetical protein  28.24 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0175981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  25.94 
 
 		 864 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0553  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.75 
 
 		 397 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0588  parallel beta-helix repeat protein  37.04 
 
 		 396 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.74 
 
 		 310 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2896  hypothetical protein  25.47 
 
 		 401 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3293  hypothetical protein  29.49 
 
 		 277 aa  48.9  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  decreased coverage  0.00624598 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  36.11 
 
 		 744 aa  48.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4250  hypothetical protein  26.82 
 
 		 634 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.35 
 
 		 379 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>