290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0624 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  59.18 
 
 		 861 aa  998    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  51.78 
 
 		 833 aa  778    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1601 aa  3279    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  58.65 
 
 		 1294 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0097  beta-mannanase/endoglucanase A  55.79 
 
 		 563 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0700472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  50 
 
 		 920 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  33.39 
 
 		 591 aa  265  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.07 
 
 		 582 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  29.86 
 
 		 578 aa  200  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  30 
 
 		 1100 aa  198  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.92 
 
 		 998 aa  195  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.34 
 
 		 900 aa  190  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  28.17 
 
 		 571 aa  190  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  28.12 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3062  hypothetical protein  29.73 
 
 		 711 aa  186  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0227805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 1224 aa  185  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 895 aa  183  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 649 aa  182  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.66 
 
 		 867 aa  181  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.87 
 
 		 927 aa  181  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  28.07 
 
 		 854 aa  180  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  29.65 
 
 		 864 aa  179  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  27.71 
 
 		 885 aa  176  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  27.98 
 
 		 1105 aa  174  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.51 
 
 		 762 aa  172  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  26.88 
 
 		 646 aa  172  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 632 aa  169  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  30.61 
 
 		 875 aa  169  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  28.69 
 
 		 775 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 812 aa  165  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  26.49 
 
 		 537 aa  160  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 606 aa  159  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.15 
 
 		 851 aa  159  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  33.88 
 
 		 739 aa  155  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  28.3 
 
 		 874 aa  154  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.42 
 
 		 786 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.59 
 
 		 803 aa  142  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1503  hypothetical protein  28.74 
 
 		 761 aa  135  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  27.17 
 
 		 621 aa  125  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  34.76 
 
 		 665 aa  124  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.92 
 
 		 1076 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.93 
 
 		 611 aa  113  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.39 
 
 		 906 aa  108  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  25.19 
 
 		 620 aa  100  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  30.42 
 
 		 815 aa  100  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 611 aa  92  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1570  hypothetical protein  22.07 
 
 		 632 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475185  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  24.72 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 563 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  45.65 
 
 		 623 aa  81.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  56.92 
 
 		 477 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.91 
 
 		 710 aa  79.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  35.76 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.67 
 
 		 816 aa  78.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.43 
 
 		 469 aa  77.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  38.33 
 
 		 600 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 789 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.47 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.84 
 
 		 1057 aa  75.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  33.73 
 
 		 922 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 		 730 aa  72.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 		 928 aa  71.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  41.23 
 
 		 943 aa  71.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  48.53 
 
 		 415 aa  70.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.05 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  54.69 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 846 aa  68.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  46.97 
 
 		 590 aa  68.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  35.77 
 
 		 1150 aa  68.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  44.57 
 
 		 1565 aa  67.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  50 
 
 		 567 aa  67.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  44.3 
 
 		 884 aa  66.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  30.67 
 
 		 2031 aa  66.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.8 
 
 		 961 aa  66.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  38.79 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.02 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  35.25 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.27 
 
 		 842 aa  65.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  36.84 
 
 		 814 aa  65.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.27 
 
 		 887 aa  64.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  46.88 
 
 		 599 aa  65.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 		 736 aa  65.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50.77 
 
 		 596 aa  64.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.14 
 
 		 541 aa  63.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  44.78 
 
 		 558 aa  64.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1916 aa  64.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 566 aa  63.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  41.11 
 
 		 1104 aa  63.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  41.11 
 
 		 1104 aa  63.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.78 
 
 		 539 aa  63.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  42.05 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  24.83 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  22.81 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  42.86 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  46.97 
 
 		 591 aa  63.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>