160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2393 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  100 
 
 		 600 aa  1175    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  57.14 
 
 		 443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 357 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2048  glycoside hydrolase family protein  43.34 
 
 		 327 aa  226  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.904754  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  54.29 
 
 		 831 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  66.98 
 
 		 523 aa  127  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  60.92 
 
 		 670 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  51.19 
 
 		 524 aa  90.1  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.13 
 
 		 816 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  33.04 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  47.13 
 
 		 768 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.48 
 
 		 1057 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  29.86 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  28.75 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  26.58 
 
 		 1294 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  26.58 
 
 		 1369 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  33.5 
 
 		 940 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  26.58 
 
 		 1414 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.39 
 
 		 1732 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  51.39 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  29.59 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.18 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  28.49 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.3 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  33.14 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.12 
 
 		 1565 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.96 
 
 		 910 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  30.77 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  27.94 
 
 		 792 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  29.73 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.68 
 
 		 2554 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  27.91 
 
 		 938 aa  58.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.14 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  32.54 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.21 
 
 		 3295 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.26 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  27.73 
 
 		 918 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.3 
 
 		 2122 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  29.5 
 
 		 861 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  57.69 
 
 		 943 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  29.78 
 
 		 317 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  27.36 
 
 		 1556 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1282 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29.1 
 
 		 963 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.32 
 
 		 507 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  30.11 
 
 		 460 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  26.21 
 
 		 2000 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  26.67 
 
 		 1027 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  50 
 
 		 884 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.79 
 
 		 1094 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  25.96 
 
 		 938 aa  54.7  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.16 
 
 		 1528 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.05 
 
 		 3197 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  27.64 
 
 		 517 aa  54.3  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  24.59 
 
 		 669 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.31 
 
 		 1667 aa  53.9  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  25.37 
 
 		 713 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.29 
 
 		 2036 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  37.35 
 
 		 945 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  28.5 
 
 		 971 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1682 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  29.21 
 
 		 941 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.11 
 
 		 947 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.09 
 
 		 930 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  28.8 
 
 		 1842 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  22.57 
 
 		 859 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  29.46 
 
 		 530 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.76 
 
 		 1969 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.84 
 
 		 601 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.28 
 
 		 1150 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  24.76 
 
 		 1300 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  22.32 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  23.5 
 
 		 184 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  31.87 
 
 		 861 aa  50.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  24.87 
 
 		 951 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.76 
 
 		 1356 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1667 aa  50.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.59 
 
 		 1862 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  37.35 
 
 		 852 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  29.35 
 
 		 523 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 699 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  24.07 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  23.97 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.9 
 
 		 752 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.13 
 
 		 978 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.14 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  42.11 
 
 		 814 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  25.6 
 
 		 917 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  27.23 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.38 
 
 		 1882 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 		 2066 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.36 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.65 
 
 		 769 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  29.71 
 
 		 519 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  24.76 
 
 		 675 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.29 
 
 		 1241 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  23.5 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  29.58 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  30 
 
 		 1387 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 3197 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>