237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4152 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  100 
 
 		 449 aa  916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  57.88 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  54.09 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  50.59 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  64.95 
 
 		 523 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  56.79 
 
 		 543 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  46.74 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  46.09 
 
 		 445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  51.17 
 
 		 561 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.17 
 
 		 507 aa  295  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  44.74 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  45 
 
 		 1294 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  45 
 
 		 1414 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  48.09 
 
 		 1369 aa  259  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.52 
 
 		 558 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  61 
 
 		 673 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  60 
 
 		 441 aa  123  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  26.87 
 
 		 732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  57 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  60.42 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.44 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  54.26 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.15 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  56.84 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  49.15 
 
 		 847 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  52.58 
 
 		 702 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  52 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  53.85 
 
 		 681 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  49.49 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  51.58 
 
 		 593 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.48 
 
 		 456 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  52.53 
 
 		 1209 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  53.06 
 
 		 763 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  49.45 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.39 
 
 		 913 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.54 
 
 		 1121 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.35 
 
 		 846 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  51.09 
 
 		 774 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  53.26 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.29 
 
 		 609 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  45.83 
 
 		 490 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  49.48 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  47.87 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.23 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  49.45 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  25.98 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.96 
 
 		 743 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.83 
 
 		 688 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51.65 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.43 
 
 		 925 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  48.45 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  41.51 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.09 
 
 		 984 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  51.22 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  45.65 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  52.44 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  42.86 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  45.05 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  42.73 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.26 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  46.94 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  43.96 
 
 		 743 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  46.24 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  46.24 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.95 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.83 
 
 		 812 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46.32 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.57 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.65 
 
 		 778 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  40.68 
 
 		 681 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  47.9 
 
 		 978 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.39 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  40.95 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  42.71 
 
 		 851 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  52.7 
 
 		 829 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 1055 aa  77.4  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  42.96 
 
 		 900 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  43.64 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  40.95 
 
 		 934 aa  77  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 744 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.25 
 
 		 998 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 628 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.71 
 
 		 880 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.62 
 
 		 623 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  40.66 
 
 		 842 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  47.78 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  45.83 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.56 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.17 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 1298 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  41.24 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  44.58 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  40.59 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  45.45 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>