27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0656 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 507 aa  1018    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  53.77 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  41.84 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.54 
 
 		 543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.2 
 
 		 449 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  43.26 
 
 		 523 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  45.51 
 
 		 445 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  44.03 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.61 
 
 		 453 aa  289  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.4 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  47.37 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  47.19 
 
 		 1294 aa  259  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  47.19 
 
 		 1414 aa  259  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  47.19 
 
 		 1369 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  32.47 
 
 		 558 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.8 
 
 		 732 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  27.23 
 
 		 850 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  62.86 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  25.73 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  56.1 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  24.04 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  57.5 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.71 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  55.56 
 
 		 725 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  19.44 
 
 		 863 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 556 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.41 
 
 		 1194 aa  43.9  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>