188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2636 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 621 aa  1242    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  43.91 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  43.53 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 814 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  32.69 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  32.6 
 
 		 475 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  32.81 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.3 
 
 		 516 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  33.62 
 
 		 743 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  34.38 
 
 		 593 aa  157  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  33.02 
 
 		 681 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  30.57 
 
 		 578 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  51.38 
 
 		 619 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  32.16 
 
 		 589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  29.23 
 
 		 584 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.14 
 
 		 900 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  46.34 
 
 		 558 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  26.24 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  29.03 
 
 		 572 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  43.56 
 
 		 725 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.79 
 
 		 335 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26.95 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  45.69 
 
 		 791 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.47 
 
 		 312 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.82 
 
 		 332 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  32.79 
 
 		 772 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  50 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  46.91 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.47 
 
 		 673 aa  81.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  64.71 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  29.07 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  41.46 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.39 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.08 
 
 		 984 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  36.46 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 854 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  24.7 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  35.71 
 
 		 925 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 		 1209 aa  67.8  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.11 
 
 		 436 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.46 
 
 		 364 aa  67  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  36.72 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  36.56 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  43.04 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  36.08 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  35.42 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  36.73 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.25 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  39.8 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  39.24 
 
 		 1137 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 		 1128 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.13 
 
 		 933 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.48 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  28.71 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 562 aa  62  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.97 
 
 		 1298 aa  62  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.24 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  38.78 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  34.57 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  32.1 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.3 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  39.74 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  63.89 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  35.11 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.25 
 
 		 674 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.17 
 
 		 743 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.23 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  37.33 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  30.36 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  32.1 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.25 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  38.37 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.21 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  36.47 
 
 		 775 aa  57  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.46 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  37.84 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  33.68 
 
 		 842 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  30.56 
 
 		 637 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  36.47 
 
 		 935 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  36.28 
 
 		 511 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  24.1 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  35.11 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  34.09 
 
 		 495 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  36 
 
 		 756 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.35 
 
 		 812 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  25.29 
 
 		 773 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.58 
 
 		 378 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  29.9 
 
 		 906 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  38.55 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 540 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  37.84 
 
 		 442 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 674 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.75 
 
 		 674 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>