41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1586 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  100 
 
 
545 aa  1106    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  30.67 
 
 
578 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  30.55 
 
 
681 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  33.33 
 
 
572 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  29.67 
 
 
593 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  31.92 
 
 
589 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  29.57 
 
 
743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  28.52 
 
 
572 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  40.34 
 
 
814 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  33.03 
 
 
584 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  32.81 
 
 
621 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  34.43 
 
 
900 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 
502 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  32.54 
 
 
566 aa  157  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  31.04 
 
 
469 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  31.45 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  35.79 
 
 
335 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
335 aa  146  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  30.58 
 
 
475 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  28 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 
343 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  29.97 
 
 
332 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  30.45 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  28.53 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  27.64 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.2 
 
 
673 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 
373 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 
377 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  26.71 
 
 
333 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
365 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 
359 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  26.03 
 
 
382 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  31.82 
 
 
535 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  24.34 
 
 
356 aa  47  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  25.37 
 
 
331 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  23.96 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  24.34 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  24.38 
 
 
1004 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24 
 
 
370 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.85 
 
 
337 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>