232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1051 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 700 aa  1396    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  47.07 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  49.17 
 
 		 511 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  36.51 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3779  pectate lyase  39.93 
 
 		 350 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  38.36 
 
 		 552 aa  190  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1159  pectate lyase  36.89 
 
 		 354 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4116  pectate lyase  34.97 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  46.63 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0380  pectate lyase  31.39 
 
 		 416 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1434  pectate lyase  32.19 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  52.21 
 
 		 1316 aa  127  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  45.99 
 
 		 789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  44.72 
 
 		 933 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  43.8 
 
 		 769 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  42.24 
 
 		 787 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.51 
 
 		 867 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  41.61 
 
 		 914 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  42.15 
 
 		 401 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  38.19 
 
 		 747 aa  94.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  37.33 
 
 		 649 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  45.13 
 
 		 725 aa  87.8  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.54 
 
 		 831 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  36.8 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.98 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  43.16 
 
 		 791 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.85 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  42.99 
 
 		 820 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  36.57 
 
 		 847 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  38.39 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  46.91 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.21 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  28.35 
 
 		 1016 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.76 
 
 		 494 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.36 
 
 		 984 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  40.51 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.76 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  43.48 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.42 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  35.59 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.98 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  40 
 
 		 781 aa  67.4  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  37.36 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  39.51 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 1128 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.18 
 
 		 756 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  26.4 
 
 		 773 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  39.51 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  38.71 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.91 
 
 		 979 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  35.16 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.36 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  38.55 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 854 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.82 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  35.16 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  40.74 
 
 		 894 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  38.89 
 
 		 456 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  40.74 
 
 		 460 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  38.89 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  35.16 
 
 		 842 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  35.16 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  43.02 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  34.69 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  32.81 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  38.71 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  34.23 
 
 		 613 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.51 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1698  hypothetical protein  25 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498115  normal  0.0888224 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  35.37 
 
 		 906 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  41.49 
 
 		 935 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  34.36 
 
 		 1207 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 1209 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.63 
 
 		 763 aa  62  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  35.42 
 
 		 460 aa  62  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  30.77 
 
 		 898 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  41.89 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  34.07 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  36 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  42.68 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.22 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1167 aa  60.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  38.2 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.91 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.51 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.27 
 
 		 590 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  37.36 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  39.13 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  34.94 
 
 		 913 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  38.64 
 
 		 1298 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  40.74 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.17 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  40.86 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>