242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1134 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  59.97 
 
 		 974 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.26 
 
 		 984 aa  766    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  57.84 
 
 		 894 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  68.05 
 
 		 854 aa  951    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  64.73 
 
 		 1121 aa  852    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  62.6 
 
 		 785 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  73.32 
 
 		 900 aa  973    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  52.03 
 
 		 741 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  63.12 
 
 		 966 aa  801    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  60.33 
 
 		 973 aa  808    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  63.59 
 
 		 963 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  61.54 
 
 		 979 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  60.24 
 
 		 854 aa  803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.58 
 
 		 919 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 842 aa  1721    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  56.25 
 
 		 722 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  58.36 
 
 		 1478 aa  775    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  58.2 
 
 		 1904 aa  772    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  58.36 
 
 		 1759 aa  773    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.83 
 
 		 938 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  99.35 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  62.14 
 
 		 580 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  58.18 
 
 		 934 aa  129  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  48.72 
 
 		 389 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  55.88 
 
 		 990 aa  120  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50.49 
 
 		 489 aa  117  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  51.89 
 
 		 690 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50.94 
 
 		 880 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  53.47 
 
 		 775 aa  111  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  53 
 
 		 596 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  54.9 
 
 		 688 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.73 
 
 		 423 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  50 
 
 		 646 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  53.92 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 		 846 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  47.06 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  46.09 
 
 		 609 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  48.54 
 
 		 488 aa  105  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.6 
 
 		 998 aa  105  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51 
 
 		 393 aa  104  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  52.88 
 
 		 494 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  47.52 
 
 		 669 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  47.57 
 
 		 597 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  49 
 
 		 436 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  51.96 
 
 		 518 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.63 
 
 		 875 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  48.51 
 
 		 432 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.52 
 
 		 588 aa  101  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 743 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 620 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  50 
 
 		 681 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.53 
 
 		 767 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 		 589 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 913 aa  98.2  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  52.48 
 
 		 488 aa  97.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 774 aa  97.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 746 aa  97.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  44.83 
 
 		 681 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  49.02 
 
 		 429 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.12 
 
 		 469 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  46.02 
 
 		 851 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.09 
 
 		 499 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  46.15 
 
 		 491 aa  95.1  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.58 
 
 		 487 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46 
 
 		 590 aa  94.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  41.09 
 
 		 794 aa  94.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  46.6 
 
 		 364 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 1055 aa  94  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  39.85 
 
 		 942 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 		 812 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45.87 
 
 		 486 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 491 aa  93.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 727 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  46.81 
 
 		 598 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.12 
 
 		 773 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.23 
 
 		 543 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  45.19 
 
 		 935 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  41.09 
 
 		 436 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 376 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 		 1209 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.51 
 
 		 864 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 744 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  43.14 
 
 		 605 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.75 
 
 		 906 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 1128 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.04 
 
 		 925 aa  88.6  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 938 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  46.74 
 
 		 763 aa  88.2  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  42.86 
 
 		 468 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  50.59 
 
 		 460 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  41.94 
 
 		 694 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  45.71 
 
 		 719 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  40 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 894 aa  86.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.71 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.1 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  41.18 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>