280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4558 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  69.63 
 
 		 998 aa  1026    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  54.71 
 
 		 1100 aa  757    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  62.08 
 
 		 851 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 864 aa  1747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  51.25 
 
 		 1105 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  61.64 
 
 		 762 aa  854    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.08 
 
 		 786 aa  728    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  47.44 
 
 		 875 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.52 
 
 		 927 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  42.2 
 
 		 895 aa  529  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  45.62 
 
 		 1224 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  52.2 
 
 		 775 aa  522  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.26 
 
 		 812 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.05 
 
 		 867 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  38 
 
 		 885 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  36.52 
 
 		 874 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.38 
 
 		 611 aa  350  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.01 
 
 		 582 aa  258  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  32.3 
 
 		 854 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  31.18 
 
 		 571 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  33.11 
 
 		 578 aa  237  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.52 
 
 		 591 aa  230  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  29.73 
 
 		 587 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.07 
 
 		 646 aa  207  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 649 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 1601 aa  187  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.16 
 
 		 833 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  28.95 
 
 		 537 aa  163  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.12 
 
 		 900 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.67 
 
 		 925 aa  104  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.86 
 
 		 739 aa  104  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  26.46 
 
 		 665 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 628 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  24.95 
 
 		 803 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43.33 
 
 		 744 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 743 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 688 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.63 
 
 		 494 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.42 
 
 		 1209 aa  96.3  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.63 
 
 		 1076 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  25.93 
 
 		 906 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.9 
 
 		 486 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 934 aa  96.3  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.51 
 
 		 773 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.69 
 
 		 778 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.9 
 
 		 621 aa  94.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.16 
 
 		 436 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.65 
 
 		 854 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.74 
 
 		 669 aa  92  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.75 
 
 		 518 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  45.05 
 
 		 942 aa  92  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35.57 
 
 		 1007 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  41.75 
 
 		 681 aa  91.3  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.51 
 
 		 623 aa  91.3  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.08 
 
 		 393 aa  91.3  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  46.32 
 
 		 763 aa  90.9  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.19 
 
 		 984 aa  90.9  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 846 aa  90.9  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  43.27 
 
 		 974 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.49 
 
 		 978 aa  90.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.78 
 
 		 469 aa  90.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  43.27 
 
 		 489 aa  90.5  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.19 
 
 		 979 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.51 
 
 		 842 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 606 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.75 
 
 		 455 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.75 
 
 		 446 aa  89  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.45 
 
 		 488 aa  89  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.35 
 
 		 681 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  40.23 
 
 		 456 aa  87.8  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.08 
 
 		 590 aa  87.8  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 		 894 aa  87.8  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  43.93 
 
 		 376 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.2 
 
 		 913 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  46.99 
 
 		 1137 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 774 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  41.59 
 
 		 605 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.78 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  40.78 
 
 		 1055 aa  85.9  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.38 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  45.45 
 
 		 1298 aa  86.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.62 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.51 
 
 		 746 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  44.66 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 		 1128 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.71 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  40.38 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.73 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  39.42 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.12 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  39.53 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.9 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.05 
 
 		 815 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.78 
 
 		 543 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  35.19 
 
 		 609 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.07 
 
 		 2042 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.05 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>